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Enregistrement W3126485696 · doi:10.1111/pce.14012

Single cell gene regulatory networks in plants: Opportunities for enhancing climate change stress resilience

2021· review· en· W3126485696 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePlant Cell & Environment · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésResilience (materials science)Climate changeGene regulatory networkGeneEnvironmental resource managementEnvironmental planningEnvironmental scienceBiologyEcologyGeneticsGene expressionMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Global warming poses major challenges for plant survival and agricultural productivity. Thus, efforts to enhance stress resilience in plants are key strategies for protecting food security. Gene regulatory networks (GRNs) are a critical mechanism conferring stress resilience. Until recently, predicting GRNs of the individual cells that make up plants and other multicellular organisms was impeded by aggregate population scale measurements of transcriptome and other genome-scale features. With the advancement of high-throughput single cell RNA-seq and other single cell assays, learning GRNs for individual cells is now possible, in principle. In this article, we report on recent advances in experimental and analytical methodologies for single cell sequencing assays especially as they have been applied to the study of plants. We highlight recent advances and ongoing challenges for scGRN prediction, and finally, we highlight the opportunity to use scGRN discovery for studying and ultimately enhancing abiotic stress resilience in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,933
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle