MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3126523341 · doi:10.1186/s13007-021-00714-9

A hybrid model based on general regression neural network and fruit fly optimization algorithm for forecasting and optimizing paclitaxel biosynthesis in Corylus avellana cell culture

2021· article· en· W3126523341 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Methods · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Treatment and Pharmacology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPaclitaxelElicitorCell cultureArtificial neural networkExtracellularAlgorithmBotanyBiologyChemistryMathematicsBiochemistryComputer scienceMachine learningChemotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Paclitaxel is a well-known chemotherapeutic agent widely applied as a therapy for various types of cancers. In vitro culture of Corylus avellana has been named as a promising and low-cost strategy for paclitaxel production. Fungal elicitors have been reported as an impressive strategy for improving paclitaxel biosynthesis in cell suspension culture (CSC) of C. avellana . The objectives of this research were to forecast and optimize growth and paclitaxel biosynthesis based on four input variables including cell extract (CE) and culture filtrate (CF) concentration levels, elicitor adding day and CSC harvesting time in C. avellana cell culture, as a case study, using general regression neural network-fruit fly optimization algorithm (GRNN-FOA) via data mining approach for the first time. Results GRNN-FOA models (0.88–0.97) showed the superior prediction performances as compared to regression models (0.57–0.86). Comparative analysis of multilayer perceptron-genetic algorithm (MLP-GA) and GRNN-FOA showed very slight difference between two models for dry weight (DW), intracellular and extracellular paclitaxel in testing subset, the unseen data. However, MLP-GA was slightly more accurate as compared to GRNN-FOA for total paclitaxel and extracellular paclitaxel portion in testing subset. The slight difference was observed in maximum growth and paclitaxel biosynthesis optimized by FOA and GA. The optimization analysis using FOA on developed GRNN-FOA models showed that optimal CE [4.29% (v/v)] and CF [5.38% (v/v)] concentration levels, elicitor adding day (17) and harvesting time (88 h and 19 min) can lead to highest paclitaxel biosynthesis (372.89 µg l −1 ). Conclusions Great accordance between the predicted and observed values of DW, intracellular, extracellular and total yield of paclitaxel, and also extracellular paclitaxel portion support excellent performance of developed GRNN-FOA models. Overall, GRNN-FOA as new mathematical tool may pave the way for forecasting and optimizing secondary metabolite production in plant in vitro culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle