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Enregistrement W3126606874 · doi:10.1101/2021.02.06.430066

Cold adapted desiccation-tolerant bacteria isolated from polar soils presenting high resistance to anhydrobiosis

2021· preprint· en· W3126606874 sur OpenAlexafffund
Felipe Nóbrega, Rubens Tadeu Delgado Duarte, Adriana Torres-Ballesteros, Luciano Lopes Queiroz, Lyle G. Whyte, Vivian H. Pellizari

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePolar Research and Ecology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésDesiccationCryptobiosisMicroorganismDesiccation toleranceSoil waterBiologyActinobacteriaBotanyEcologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Life on Earth is strictly dependent on liquid water. In polar terrestrial environments, water exists in solid state during almost the entire year. Polar microorganisms have not only to adjust their metabolism to survive at subzero temperatures, but also need to cope with extremely dry conditions. We investigated the presence of desiccation-adapted bacteria in Arctic permafrost and Antarctic surface soils and characterized their survivability to dryness. We selected desiccation tolerant cells by treating the soils with chloroform prior to cultivation, in order to mimic the stress of low water activity for long periods. From over 1000 colonies from different samples, 23 unique strains were selected and identified as members of phyla Firmicutes, Proteobacteria and Actinobacteria . About 60% of the strains survived after 50 days in anhydrobiosis. The competence to withstand desiccation varied between close related strains isolated from different locations, bringing the question if environmental conditions may play a role in the observed desiccation tolerance. Survivability was also affected by the solution in which the cells were suspended before drying; R2B medium being more protective than water. This is the first time that chloroform was used to select desiccation tolerant microorganisms from polar soils. The collection of polar microorganisms described herein opens the possibility of further experiments aiming to investigate the resistance mechanisms of polar anhydrobionts. Desiccation tolerance is fundamental to the survivability of microorganisms to the space environment and at the surface of thin-atmosphere planets like Mars. Therefore, the selected strains may open a road to better understand the limits of cold adapted life on Earth and beyond, and compare mechanisms of resistance with anhydrobionts from divergent extreme environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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