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Enregistrement W3126966743 · doi:10.1021/acs.jmedchem.1c00034

Identification and Profiling of a Novel Diazaspiro[3.4]octane Chemical Series Active against Multiple Stages of the Human Malaria Parasite <i>Plasmodium falciparum</i> and Optimization Efforts

2021· article· en· W3126966743 sur OpenAlexaff
Claire Le Manach, Jean Dam, John G. Woodland, Gurminder Kaur, Lutete Peguy Khonde, Christel Brunschwig, Mathew Njoroge, Kathryn J. Wicht, André Horatscheck, Tanya Paquet, Grant A. Boyle, Liezl Gibhard, Dale Taylor, Nina Lawrence, Tomas Yeo, Sachel Mok, Richard T. Eastman, Dorjbal Dorjsuren, Daniel C. Talley, Hui Guo, Anton Simeonov, Janette Reader, Mariëtte van der Watt, Erica Erlank, Nelius Venter, Jacek W. Zawada, Ayesha S. Aswat, Luisa Nardini, Thérèsa L. Coetzer, Sonja B. Lauterbach, Belinda Bezuidenhout, Anjo Theron, Dalu Mancama, Lizette L. Koekemoer, Lyn‐Marié Birkholtz, Sergio Wittlin, Michael J. Delves, Sabine Ottilie, Elizabeth A. Winzeler, Thomas W von Geldern, Dennis H. Smith, David A. Fidock, Leslie J. Street, Gregory S. Basarab, James Duffy

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensCanada Malting (Canada)
Organismes subventionnairesMedicines for Malaria Venture
Mots-clésChemistryPlasmodium falciparumMalariaProfiling (computer programming)OctaneIdentification (biology)Computational biologyParasite hostingCombinatorial chemistryOrganic chemistryImmunologyBiologyComputer scienceEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel diazaspiro[3.4]octane series was identified from a Plasmodium falciparum whole-cell high-throughput screening campaign. Hits displayed activity against multiple stages of the parasite lifecycle, which together with a novel sp 3 -rich scaffold provided an attractive starting point for a hit-to-lead medicinal chemistry optimization and biological profiling program. Structure–activity-relationship studies led to the identification of compounds that showed low nanomolar asexual blood-stage activity (<50 nM) together with strong gametocyte sterilizing properties that translated to transmission-blocking activity in the standard membrane feeding assay. Mechanistic studies through resistance selection with one of the analogues followed by whole-genome sequencing implicated the P. falciparum cyclic amine resistance locus in the mode of resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,326

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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