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Enregistrement W3127117437 · doi:10.3390/microorganisms9020356

Syntrophic Hydrocarbon Degradation in a Decommissioned Off-Shore Subsea Oil Storage Structure

2021· article· en· W3127117437 sur OpenAlexaff
Adrien Vigneron, Perrine Cruaud, Frederic Ducellier, Ian M. Head, Nicolas Tsesmetzis

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilSight Research UKShell Global Solutions InternationalShell
Mots-clésMetagenomicsMicrobial population biologyBioremediationMicrobial ecologyProduced waterEnvironmental chemistryEnvironmental scienceBiologyEcologyChemistryContaminationEnvironmental engineeringBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the last decade, metagenomic studies have revealed the impact of oil production on the microbial ecology of petroleum reservoirs. However, despite their fundamental roles in bioremediation of hydrocarbons, biocorrosion, biofouling and hydrogen sulfide production, oil field and oil production infrastructure microbiomes are poorly explored. Understanding of microbial activities within oil production facilities is therefore crucial for environmental risk mitigation, most notably during decommissioning. The analysis of the planktonic microbial community from the aqueous phase of a subsea oil-storage structure was conducted. This concrete structure was part of the production platform of the Brent oil field (North Sea), which is currently undergoing decommissioning. Quantification and sequencing of microbial 16S rRNA genes, metagenomic analysis and reconstruction of metagenome assembled genomes (MAGs) revealed a unique microbiome, strongly dominated by organisms related to Dethiosulfatibacter and Cloacimonadetes. Consistent with the hydrocarbon content in the aqueous phase of the structure, a strong potential for degradation of low molecular weight aromatic hydrocarbons was apparent in the microbial community. These degradation pathways were associated with taxonomically diverse microorganisms, including the predominant Dethiosulfatibacter and Cloacimonadetes lineages, expanding the list of potential hydrocarbon degraders. Genes associated with direct and indirect interspecies exchanges (multiheme type-C cytochromes, hydrogenases and formate/acetate metabolism) were widespread in the community, suggesting potential syntrophic hydrocarbon degradation processes in the system. Our results illustrate the importance of genomic data for informing decommissioning strategies in marine environments and reveal that hydrocarbon-degrading community composition and metabolisms in man-made marine structures might differ markedly from natural hydrocarbon-rich marine environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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