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Enregistrement W3127278346 · doi:10.1002/lipd.12299

Production of <scp>C6–C14</scp> Medium‐Chain Fatty Acids in Seeds and Leaves <i>via</i> Overexpression of Single Hotdog‐Fold Acyl‐Lipid Thioesterases

2021· article· en· W3127278346 sur OpenAlexafffund
Rebecca S. Kalinger, D. R. Williams, Ali Ahmadi Pirshahid, Ian P. Pulsifer, Owen Rowland

Notice bibliographique

RevueLipids · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCamelina sativaCamelinaThioesteraseBiochemistryArabidopsisMetabolic engineeringNicotiana benthamianaArabidopsis thalianaFatty acidBiologyFatty acid synthesisEnzymeChemistryBiosynthesisFood scienceGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ACYL-LIPID THIOESTERASES (ALT) are a type of plant acyl-acyl carrier protein thioesterase that generate a wide range of medium-chain fatty acids and methylketone (MK) precursors when expressed heterologously in Escherichia coli. While this makes ALT-type thioesterases attractive as metabolic engineering targets to increase production of high-value medium-chain fatty acids and MKs in plant systems, the behavior of ALT enzymes in planta was not well understood before this study. To profile the substrate specificities of ALT-type thioesterases in different plant tissue types, AtALT1-4 from Arabidopsis thaliana, which have widely varied chain length and oxidation state preferences in E. coli, were overexpressed in Arabidopsis seeds, Camelina sativa seeds, and Nicotiana benthamiana leaves. Seed-specific overexpression of ALT enzymes led to medium-chain fatty acid accumulation in Arabidopsis and Camelina seed triacylglycerols, and transient overexpression in N. benthamiana demonstrated that the substrate preferences of ALT-type thioesterases in planta generally agree with those previously determined in E. coli. AtALT1 and AtALT4 overexpression in leaves and seeds resulted in the accumulation of 12-14 carbon-length fatty acids and 6-8 carbon-length fatty acids, respectively. While it was difficult to completely profile the products of ALT-type thioesterases that generate MK precursors (i.e. β-keto fatty acids), our results nonetheless demonstrate that ALT enzymes are catalytically diverse in planta. The knowledge gained from this study is a significant step towards being able to use ALT-type thioesterases as metabolic engineering tools to modify the fatty acid profiles of oilseed crops, other plants, and microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,773

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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