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Enregistrement W3127286352 · doi:10.1109/tmi.2021.3071951

Echo-SyncNet: Self-Supervised Cardiac View Synchronization in Echocardiography

2021· preprint· en· W3127286352 sur OpenAlexafffund
Fatemeh Taheri Dezaki, Christina Luong, Tom Ginsberg, Robert Rohling, Ken Gin, Purang Abolmaesumi, Teresa S.M. Tsang

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Medical Imaging · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePhonocardiography and Auscultation Techniques
Établissements canadiensVancouver Coastal HealthVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSynchronizingEcho (communications protocol)Computer scienceArtificial intelligenceSynchronization (alternating current)Feature (linguistics)Pattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In echocardiography (echo), an electrocardiogram (ECG) is conventionally used to temporally align different cardiac views for assessing critical measurements. However, in emergencies or point-of-care situations, acquiring an ECG is often not an option, hence motivating the need for alternative temporal synchronization methods. Here, we propose Echo-SyncNet, a self-supervised learning framework to synchronize various cross-sectional 2D echo series without any human supervision or external inputs. The proposed framework takes advantage of two types of supervisory signals derived from the input data: spatiotemporal patterns found between the frames of a single cine (intra-view self-supervision) and interdependencies between multiple cines (inter-view self-supervision). The combined supervisory signals are used to learn a feature-rich and low dimensional embedding space where multiple echo cines can be temporally synchronized. Two intra-view self-supervisions are used, the first is based on the information encoded by the temporal ordering of a cine (temporal intra-view) and the second on the spatial similarities between nearby frames (spatial intra-view). The inter-view self-supervision is used to promote the learning of similar embeddings for frames captured from the same cardiac phase in different echo views. We evaluate the framework with multiple experiments: 1) Using data from 998 patients, Echo-SyncNet shows promising results for synchronizing Apical 2 chamber and Apical 4 chamber cardiac views, which are acquired spatially perpendicular to each other; 2) Using data from 3070 patients, our experiments reveal that the learned representations of Echo-SyncNet outperform a supervised deep learning method that is optimized for automatic detection of fine-grained cardiac cycle phase; 3) We go one step further and show the usefulness of the learned representations in a one-shot learning scenario of cardiac key-frame detection. Without any fine-tuning, key frames in 1188 validation patient studies are identified by synchronizing them with only one labeled reference cine. We do not make any prior assumption about what specific cardiac views are used for training, and hence we show that Echo-SyncNet can accurately generalize to views not present in its training set. Project repository: github.com/fatemehtd/Echo-SyncNet>.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,959
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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