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Enregistrement W3127487470 · doi:10.1038/s41379-021-00737-6

Novel, emerging and provisional renal entities: The Genitourinary Pathology Society (GUPS) update on renal neoplasia

2021· article· en· W3127487470 sur OpenAlexaff
Kiril Trpkov, Sean R. Williamson, Anthony J. Gill, Adebowale Adeniran, Abbas Agaimy, Reza Alaghehbandan, Mahul B. Amin, Pedram Argani, Ying‐Bei Chen, Liang Cheng, Jonathan I. Epstein, John C. Cheville, Éva Compérat, Isabela Werneck da Cunha, Jennifer Gordetsky, Sounak Gupta, Huiying He, Michelle S. Hirsch, Peter A. Humphrey, Payal Kapur, Fumiyoshi Kojima, José I. López, Fiona Maclean, Cristina Magi‐Galluzzi, Jesse K. McKenney, Rohit Mehra, Santosh Menon, George J. Netto, Christopher G. Przybycin, Priya Rao, Qiu Rao, Victor E. Reuter, Rola Saleeb, Rajal B. Shah, Steven C. Smith, Satish K. Tickoo, Maria Tretiakova, Lawrence D. True, Virginie Verkarre, Sara E. Wobker, Ming Zhou, Ondřej Hes

Notice bibliographique

RevueModern Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaRoyal Columbian HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRenal cell carcinomaMedicinePathologyGenitourinary systemRenal pathologyHematopathologyKidneyInternal medicineBiologyCytogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Genitourinary Pathology Society (GUPS) undertook a critical review of the recent advances in renal neoplasia, particularly focusing on the newly accumulated evidence post-2016 World Health Organization (WHO) classification. In the era of evolving histo-molecular classification of renal neoplasia, morphology is still key. However, entities (or groups of entities) are increasingly characterized by specific molecular features, often associated either with recognizable, specific morphologies or constellations of morphologies and corresponding immunohistochemical profiles. The correct diagnosis has clinical implications leading to better prognosis, potential clinical management with targeted therapies, may identify hereditary or syndromic associations, which may necessitate appropriate genetic testing. We hope that this undertaking will further facilitate the identification of these entities in practice. We also hope that this update will bring more clarity regarding the evolving classification of renal neoplasia and will further reduce the category of "unclassifiable renal carcinomas/tumors". We propose three categories of novel entities: (1) "Novel entity", validated by multiple independent studies; (2) "Emerging entity", good compelling data available from at least two or more independent studies, but additional validation is needed; and (3) "Provisional entity", limited data available from one or two studies, with more work required to validate them. For some entities initially described using different names, we propose new terminologies, to facilitate their recognition and to avoid further diagnostic dilemmas. Following these criteria, we propose as novel entities: eosinophilic solid and cystic renal cell carcinoma (ESC RCC), renal cell carcinoma with fibromyomatous stroma (RCC FMS) (formerly RCC with leiomyomatous or smooth muscle stroma), and anaplastic lymphoma kinase rearrangement-associated renal cell carcinoma (ALK-RCC). Emerging entities include: eosinophilic vacuolated tumor (EVT) and thyroid-like follicular renal cell carcinoma (TLFRCC). Finally, as provisional entities, we propose low-grade oncocytic tumor (LOT), atrophic kidney-like lesion (AKLL), and biphasic hyalinizing psammomatous renal cell carcinoma (BHP RCC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0080,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,006
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations220
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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