Whole exome sequencing reveals a biallelic frameshift mutation in <i>GRXCR2</i> in hearing impairment in Cameroon
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hearing impairment (HI) genes are poorly studied in African populations. METHODS: We used whole exome sequencing (WES) to investigate pathogenic and likely pathogenic (PLP) variants in 10 individuals with HI, from four multiplex families from Cameroon, two of which were previously unresolved with a targeted gene enrichment (TGE) panel of 116 genes. In silico protein modelling, western blotting and live imaging of transfected HEK293 cells were performed to study protein structure and functions. RESULTS: All PLP variants previously identified with TGE were replicated. In one previously unresolved family, we found a homozygous frameshift PLP variant in GRXCR2 (OMIM: 615762), NM_001080516.1(GRXCR2):c.251delC p.(Ile85SerfsTer33), in two affected siblings; and additionally, in 1/80 unrelated individuals affected with non-syndromic hearing impairment (NSHI). The GRXCR2-c.251delC variant introduced a premature stop codon, leading to truncation and loss of a zinc-finger domain. Fluorescence confocal microscopy tracked the wild-type GRXCR2 protein to the cellular membrane, unlike the mutated GRXCR2 protein. CONCLUSION: This study confirms GRXCR2 as a HI-associated gene. GRXCR2 should be included to the currently available TGE panels for HI diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».