Proteasomal Regulation of Mammalian SPT16 in Controlling Transcription
Notice bibliographique
Résumé
ranscription), an essential and evolutionarily conserved heterodimer from yeast to humans, controls transcription and is found to be upregulated in various cancers. However, the basis for such upregulation is not clearly understood. Our recent results deciphering a new ubiquitin-proteasome system regulation of the FACT subunit SPT16 in orchestrating transcription in yeast hint at the involvement of the proteasome in controlling FACT in humans, with a link to cancer. To test this, we carried out experiments in human embryonic kidney (HEK293) cells, which revealed that human SPT16 undergoes ubiquitylation and that its abundance is increased following inhibition of the proteolytic activity of the proteasome, thus implying proteasomal regulation of human SPT16. Furthermore, we find that the increased abundance/expression of SPT16 in HEK293 cells alters the transcription of genes, including ones associated with cancer, and that the proteasomal degradation of SPT16 is impaired in kidney cancer (Caki-2) cells to upregulate SPT16. Like human SPT16, murine SPT16 in C2C12 cells also undergoes ubiquitylation and proteasomal degradation to regulate transcription. Collectively, our results reveal a proteasomal regulation of mammalian SPT16, with physiological relevance in controlling transcription, and implicate such proteasomal control in the upregulation of SPT16 in cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».