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Enregistrement W3127891190 · doi:10.1101/2021.02.02.21251008

Modelling the Impact of Prevention and Treatment Interventions on HIV and Hepatitis C Virus Transmission Among People Who Inject Drugs in Kenya

2021· preprint· en· W3127891190 sur OpenAlexaff
Jack Stone, Hannah Fraser, Josephine G. Walker, Nyashadzaishe Mafirakureva, Bernard Mundia, Charles M. Cleland, Kigen Bartilol, Helgar Musyoki, Wanjiru Waruiru, Allan Ragi, Parinita Bhattacharjee, Nok Chhun, John Lizcano, Matthew J. Akiyama, Peter Cherutich, Ann Kurth, Niklas Luhmann, Peter Vickerman

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV, Drug Use, Sexual Risk
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Institute for Health and Care ResearchGilead SciencesGlobal Fund to Fight AIDS, Tuberculosis and Malaria
Mots-clésMedicinePsychological interventionTreatment as preventionIncidence (geometry)Transmission (telecommunications)Hepatitis CSexual transmissionSyringeHuman immunodeficiency virus (HIV)Environmental healthMen who have sex with menHepatitis C virusAntiretroviral therapyDemographyVirologyViral loadInternal medicineVirusSyphilisPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background People who inject drugs (PWID) in Kenya have a high prevalence of HIV (14-26%) and HCV (11-36%). Needle and syringe programmes (NSP) and antiretroviral therapy (ART) have high coverage among PWID, while HCV treatment and opioid substitution therapy (OST) access is low. Methods A dynamic model of HIV (sexual and injecting-related) and HCV (injecting-related) transmission among PWID was calibrated using Bayesian methods to data from Nairobi and the Coastal region. We projected the impact of existing coverage levels of interventions (ART: 64-66%; OST: 4-7%; NSP: 54-56%) in each setting, and the impact over 2020-2030 of increasing the coverage of OST (50%) and NSP (75%; ‘full HR’), ART (UNAIDS 90-90-90 target), HCV treatment (1000 over 5 years), and reducing HIV sexual risk by 75%. We estimated HCV treatment levels needed to reduce HCV incidence by 90% with or without full HR. Findings Since 2013, HR has averted 15.1-20.6% (range in medians across settings) of HIV infections and 29.0-31.6% of HCV infections across Nairobi and the Coastal region, with most impact being due to NSP. Conversely, ART has only averted <5% of HIV infections since 2004 because of sub-optimal viral suppression (28-48%). Going forward, Full HR and ART could reduce HIV incidence by 58.2-62.0% and HCV incidence by 62.6-81.6% by 2030 across these settings. If sexual risk is also reduced, HIV incidence would reduce by 77.1-81.4%. Alongside full HR, treating 896 PWID over 2020-2025 could reduce HCV incidence by 90% by 2030. Interpretation Existing interventions have had moderate impact on HIV and HCV transmission in Kenya, but may have substantial impact if scaled-up. However, to achieve HIV and HCV elimination, reductions in sexual risk are needed and a scale-up in HCV treatment. Funding Global Fund, MDM

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,173
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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