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Enregistrement W3128023742 · doi:10.3389/fvets.2021.615029

Detection of Mycobacterium avium Subspecies paratuberculosis (MAP) Microorganisms Using Antigenic MAP Cell Envelope Proteins

2021· article· en· W3128023742 sur OpenAlexafffund
Karuppusamy Shanmugasundaram, Lucy M. Mutharia, D.F. Kelton, Brandon L. Plattner, S. Mallikarjunappa, Niel A. Karrow, Gordon M. Kirby

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesIndian Council of Agricultural ResearchUniversity of Guelph
Mots-clésMycobacterium avium subspecies paratuberculosisParatuberculosisPolyclonal antibodiesBiologyRecombinant DNAAntibodyAntigenMicrobiologyCell envelopeMolecular biologyMycobacteriumEscherichia coliBiochemistryBacteriaImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(MAP) that are antigenically distinct from closely related mycobacterial species are potentially useful for Johne's Disease (JD) diagnosis. We evaluated the potential of ELISAs, based on six antigenically distinct recombinant MAP cell envelope proteins (SdhA, FadE25_2, FadE3_2, Mkl, DesA2, and hypothetical protein MAP1233) as well as an extract of MAP total cell envelope proteins, to detect antibodies against MAP in the sera of infected cattle. The sensitivity (Se) and specificity (Sp) of an ELISA based on MAP total cell envelope proteins, when analyzing 153 bovine serum samples, was 75 and 96%, respectively. Analysis of the same samples, using a commercial serum ELISA resulted in a Se of 56% and Sp of 99%. Results of ELISA analysis using plates coated with recombinant cell envelope proteins ranged from a highest Se of 94% and a lowest Sp of 79% for Sdh A to a lowest Se of 67% and a highest Sp of 95% for hypothetical protein MAP1233. Using polyclonal antibodies to MAP total cell envelope proteins, immunohistochemical analysis of intestinal and lymph node tissues from JD-positive cattle detected MAP organisms whereas antibodies to recombinant proteins did not. Finally, polyclonal antibodies to MAP total cell envelope protein and to recombinant SdhA, FadE25_2, and DesA2 proteins immunomagnetically separated MAP microorganisms spiked in PBS. These results suggest that antigenically distinct MAP cell envelope proteins and antibodies to these proteins may have potential to detect MAP infection in dairy cattle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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