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Enregistrement W3128127251 · doi:10.3389/fevo.2021.538498

Genomic Insights Into the Molecular Basis of Sexual Selection in Birds

2021· article· en· W3128127251 sur OpenAlexaff
Shubham K. Jaiswal, Ankit Gupta, Aaron B. A. Shafer, V. K., Nagarjun Vijay, Vineet K. Sharma

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Behavior and Reproduction
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesIndian Institute of Science Education and Research MohaliIndian Institute of Science Education and Research Bhopal
Mots-clésBiologySexual selectionEvolutionary biologyGeneticsGenomicsGenomeNegative selectionSelection (genetic algorithm)Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sexual selection is a well-known biological process, yet the genomic basis and patterns of sexual selection are not fully understood. The extravagant ornamental plumage of peacock ( Pavo cristatus ) was instrumental in shaping Charles Darwin's theory of sexual selection and is considered to be an honest signal of its immunocompetence. Here, we used the recently generated draft genome sequence of peafowl ( Pavo cristatus ) and carried out a comparative analysis across 11 bird genomes that encompass a range of sexual selection and also had high-quality genomic and phenotypic data publically available to study the genomic basis of sexual selection. We found that varying degree of purifying selection was the predominant mechanism of action for sexual selection at the genome-wide scale and observed that sexual selection mostly influences genes regulating gene expression and protein processing. Specifically, the genome-wide phylogenetically corrected regression analysis supported the continuous or ongoing model of sexual selection. Genes involved in nucleic acid binding and gene expression regulation, including a specific regulator of sex-determination known as TRA2A to be under positive selection in the species with high post-copulatory sexual selection manifested as high sperm competition. We also detected specific feather-related and immune-related gene-pairs evolving under similar selection pressures across the 11 species, including peacock ( Pavo cristatus ), which is consistent with the Hamilton-Zuk hypothesis. The comparative genomics analysis of 11 avian taxa has provided new insights on the molecular underpinnings of sexual selection and identifies specific genomic regions for future in-depth analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,333
Score d'incertitude au seuil0,278

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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