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Enregistrement W3128148660

Vector-borne Viruses in Ungulates in Ontario, Canada: Distribution and Risk of Orbivirus Establishment

2021· dissertation· en· W3128148660 sur OpenAlexfundaboutno aff
Samantha E. Allen

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of Guelph
Mots-clésOrbivirusDistribution (mathematics)GeographyVector (molecular biology)VirologyBiologyReoviridaeVirusMathematicsGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this thesis was to investigate the potential risk posed by vector-borne pathogens to Ontario’s wildlife and livestock populations, in particular, epizootic hemorrhagic disease viruses (EHDV) and bluetongue viruses (BTV). Ontario lacks information describing the prevalence and distribution of certain vectors and pathogens despite the imminent threat vector-borne pathogens may pose to wildlife and livestock populations with their northward spread facilitated by changing climatic conditions. A retrospective analysis was performed using post-mortem findings and diagnoses for wild cervids from Ontario and Nunavut over a 27-year period to provide a long-term outlook of detected diseases and potential health threats. The most common causes of morbidity and mortality were noninfectious. Deaths attributed to infectious diseases were most often bacterial in origin. Viral vector-borne pathogens were rarely documented. We documented the first cases of EHDV (serotype 2) in free-ranging white-tailed deer in southern Ontario in 2017. Then, we sought to characterize Culicoides vector abundance and distribution, as well as assess transmission of EHDV and BTV in livestock, and BTV, EHDV, West Nile virus (WNV), eastern equine encephalitis virus (EEEV), Powassan virus (POWV) and heartland virus from free-ranging and captive cervids across Ontario for two consecutive field seasons. From June-October of 2017-2018 LED light suction traps were placed on farms and in natural areas across southern Ontario, and all Culicoides vectors collected were taxonomically identified. A total of 33,905 Culicoides spp. were collected, encompassing 14 species from seven subgenera and one species group. Culicoides sonorensis, a known vector of EHDV and BTV, was collected both years. Additionally, C. kibunensis and C. baueri were collected both years and these represent new records for Ontario, with C. baueri representing a new species record for Canada. Blood samples from 349 livestock and 217 cervids were collected from 2016 to 2019. Fifteen (9.0%) cattle were seropositive for EHDV-serotype 2. Nine (4.2%) cervids were seropositive for flaviviruses; three were confirmed as WNV, three as EEEV, and one as POWV. Collectively, these results on vector and arthropod-borne virus abundance and distribution will contribute to the development of management strategies for safeguarding Ontario livestock and wildlife populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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