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Enregistrement W3128180079 · doi:10.1038/s41396-020-00836-3

Bacterial microbiota similarity between predators and prey in a blue tit trophic network

2021· article· en· W3128180079 sur OpenAlexafffund
Hélène Dion‐Phénix, Anne Charmantier, Christophe de Franceschi, Geneviève Bourret, Steven W. Kembel, Denis Réale

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesUniversité du Québec à Montréal
Mots-clésTrophic levelBiologyGut floraEcologyHost (biology)PredationZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trophic networks are composed of many organisms hosting microbiota that interact with their hosts and with each other. Yet, our knowledge of the factors driving variation in microbiota and their interactions in wild communities is limited. To investigate the relation among host microbiota across a trophic network, we studied the bacterial microbiota of two species of primary producers (downy and holm oaks), a primary consumer (caterpillars), and a secondary consumer (blue tits) at nine sites in Corsica. To quantify bacterial microbiota, we amplified 16S rRNA gene sequences in blue tit feces, caterpillars, and leaf samples. Our results showed that hosts from adjacent trophic levels had a more similar bacterial microbiota than hosts separated by two trophic levels. Our results also revealed a difference between bacterial microbiota present on the two oak species, and among leaves from different sites. The main drivers of bacterial microbiota variation within each trophic level differed across spatial scales, and sharing the same tree or nest box increased similarity in bacterial microbiota for caterpillars and blue tits. This study quantifies host microbiota interactions across a three-level trophic network and illustrates how the factors shaping bacterial microbiota composition vary among different hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,880
Score d'incertitude au seuil0,771

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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