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Enregistrement W3128214957 · doi:10.1101/2021.02.09.430089

Ongoing production of low-fitness hybrids limits range overlap between divergent cryptic species

2021· preprint· en· W3128214957 sur OpenAlexafffundabout
Else K. Mikkelsen, Darren E. Irwin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAllopatric speciationSympatryBiologyIntrogressionHybridReproductive isolationAssortative matingRange (aeronautics)Evolutionary biologyHybrid zonePopulationEcologyZoologySympatric speciationGenetic variationMatingGene flowGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Contact zones between recently-diverged taxa provide opportunities to examine the causes of reproductive isolation and to examine the processes that determine whether two species can coexist over a broad region. The Pacific Wren ( Troglodytes pacificus ) and the Winter Wren (Troglodytes hiemalis ) are two morphologically similar songbird species that started diverging about 4 million years ago, older than most sister species pairs. The ranges of these species come into narrow contact in western Canada, where the two species remain distinct in sympatry. To assess evidence for differentiation, hybridization, and introgression in this system, we examined variation in over 250,000 single nucleotide polymorphism markers distributed across the genomes of the two species. The two species formed highly divergent genetic clusters, consistent with long-term differentiation. In a set of 75 individuals from allopatry and sympatry, two first-generation hybrids (i.e., F1’s) were detected, indicating only moderate levels of assortative mating between these taxa. We found no recent backcrosses or F2’s or other evidence of recent breeding success of F1 hybrids, indicating very low or zero fitness of F1 hybrids. Examination of genomic variation shows evidence for only a single backcrossing event in the distant past. The sizeable rate of hybridization combined with very low fitness of F1 hybrids is expected to result in a population sink in the contact zone, largely explaining the narrow overlap of the two species. If such dynamics are common in nature, they could explain the narrow range overlap often observed between pairs of closely related species. Additionally, we present evidence for a rare duplication of a large chromosomal segment from an autosome to the W chromosome, the female-specific sex chromosome in birds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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