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Enregistrement W3128361515 · doi:10.5858/2001-125-0081-cgh

Comparative Genomic Hybridization

2001· article· en· W3128361515 sur OpenAlexaff
Irene Barrett, Brenda Lomax, Tatiana Loukianova, Steven Tang, Valia S. Lestou, Dagmar K. Kalousek

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComparative genomic hybridizationAneuploidyBiologyAmniotic fluidCytogeneticsAbortionFetusAndrologyIn situ hybridizationPathologyPregnancyObstetricsGenomeGeneticsMedicineChromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To demonstrate the effectiveness of comparative genomic hybridization (CGH) for analysis of reproductive pathology specimens in clinical cytogenetics laboratories. DESIGN: A total of 856 CGH analyses were performed on various placental and fetal tissues derived from 368 specimens of spontaneous abortions and on placentas from 219 pregnancies with live-born infants. The live-born infants were clinically evaluated as normally developed, with either a normal birth weight or with intrauterine growth restriction; some live-born infants had an abnormal prenatal triple screen with normal cytogenetic results on amniotic fluid cell cultures. RESULTS: Comparative genomic hybridization analysis was successfully performed on 856 samples from spontaneously aborted specimens and term placentas. Failure of analysis occurred in 1.6% of samples and was due to an insufficient amount of tissue for DNA extraction. Comparative genomic hybridization identified aneuploidy in 53% of spontaneous abortion samples and 3.1% of term placentas. CONCLUSIONS: Comparative genomic hybridization analysis is a useful clinical tool for detection of aneuploidy in placental and fetal tissues. It provides a genome-wide screen while eliminating tissue culture failures, culture artifacts, and maternal cell contamination. We present practical guidelines for interpreting CGH profiles derived from human reproductive specimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,615
Score d'incertitude au seuil0,459

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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