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Enregistrement W3128471816 · doi:10.3389/fneur.2020.579268

Genomic Association Study for Cognitive Impairment in Parkinson's Disease

2021· article· en· W3128471816 sur OpenAlexaboutno aff
Kye Won Park, Sungyang Jo, Mi Sun Kim, Sang Ryong Jeon, Ho‐Sung Ryu, Jinhee Kim, Young‐Min Park, Seong‐Beom Koh, Jae‐Hong Lee, Sun Ju Chung

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Health and Welfare
Mots-clésMontreal Cognitive AssessmentSingle-nucleotide polymorphismMedicineInternal medicineDiseaseLogistic regressionParkinson's diseaseBonferroni correctionDementiaGenome-wide association studyCognitionGenetic associationCognitive declinePopulationOncologyPsychiatryGenotypeGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Cognitive impairment is very common in Parkinson's disease (PD) and constitutes the most debilitating complication of this disease. However, to date, few studies have investigated a genome-wide association in the development of cognitive impairment of PD. We aimed to identify the genetic loci associated with cognitive impairment in patients with sporadic PD by ethnicity-specific genotyping. Materials and methods: We recruited 1,070 patients with PD and performed a genome-wide association study using the Korean Chip, a microarray chip containing 827,400 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) optimized for the Korean population. Multiple logistic regression models adjusting for age, sex, years of education, and disease duration were used to compare between patients with and without cognitive impairment, which was defined using the Mini-Mental Status Examination (MMSE) score (MMSE score ≥ 26 vs. < 26) or the Montreal Cognitive Assessment (MoCA) score (MoCA score ≥24 vs. < 24). Results:RYR2 SNP rs10495397 was most significantly associated with cognitive impairment based on the MMSE scores (OR = 3.21; 95% CI = 1.96–5.25, P = 3.36 × 10−6) and CASC17 showed the strongest association with cognitive impairment based on the MoCA scores. However, none of the SNPs were statistically significant after Bonferroni correction. Conclusion:RYR2 may play a role in cognitive impairment in PD by the pathogenic mechanism of neuroinflammation. However, more studies are needed to replicate and validate the results of our functional study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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