Environmental DNA bioassays corroborate field data for detection of overwintering species at risk Blanding’s turtles (<i>Emydoidea blandingii</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Environmental DNA (eDNA) is gaining traction in conservation ecology as a powerful tool for detecting species at risk. We developed a quantitative polymerase chain reaction assay to detect a DNA amplicon fragment of the mitochondrial nicotinamide adenine dinucleotide locus of the Blanding’s turtle (Emydoidea blandingii) for detecting overwintering individuals. Seventy-eight water samples were collected from 17 wetland sites in Ontario, Canada. We used traditional field data to identify a priori positive and negative control sites. Fifty percent of positive control sites amplified. Detection was related to the number of individuals estimated from field observations in at least one region surveyed. Positive control sites had lower total dissolved solids and electrical conductivity in relation to negative control sites. Shedding rates were within the same order of magnitude for brumating and active turtles. We recommend collecting additional samples at a larger number of locations to maximize detection. Recommended sampling design changes may overshadow the additional effects of water chemistry and low eDNA shedding rates. eDNA offers tremendous potential to practitioners conducting species at risk assessments in environmental consulting by providing a faster, more efficient method of detection compared with traditional surveys.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».