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Enregistrement W3128666375 · doi:10.1136/gutjnl-2020-322566

Gluten-induced RNA methylation changes regulate intestinal inflammation via allele-specific <i>XPO1</i> translation in epithelial cells

2021· article· en· W3128666375 sur OpenAlexafffund
Ane Olazagoitia‐Garmendia, Linda Zhang, Paula Mera, Maialen Sebastian‐delaCruz, Iraia García‐Santisteban, Luis Manuel Mendoza, Alaín Huerta, Iñaki Irastorza, Govind Bhagat, Peter H. Green, Laura Herrero, Dolors Serra, José Antonio Rodríguez, Elena F. Verdú, Chuan He, José Ramón Bilbao, Ainara Castellanos–Rubio

Notice bibliographique

RevueGut · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIICanadian Institutes of Health ResearchMinisterio de Ciencia e InnovaciónMinisterio de Economía y CompetitividadNational Institutes of HealthNational Human Genome Research InstituteUniversity of Melbourne
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismCoeliac diseaseSNPBiologyMethylationAlleleHuman leukocyte antigenGlutenImmune systemImmunologyPathogenesisInflammationAntigenGeneGeneticsDiseaseGenotypeMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Coeliac disease (CD) is a complex autoimmune disorder that develops in genetically susceptible individuals. Dietary gluten triggers an immune response for which the only available treatment so far is a strict, lifelong gluten free diet. Human leucocyte antigen (HLA) genes and several non-HLA regions have been associated with the genetic susceptibility to CD, but their role in the pathogenesis of the disease is still essentially unknown, making it complicated to develop much needed non-dietary treatments. Here, we describe the functional involvement of a CD-associated single-nucleotide polymorphism (SNP) located in the 5’UTR of XPO1 in the inflammatory environment characteristic of the coeliac intestinal epithelium. Design The function of the CD-associated SNP was investigated using an intestinal cell line heterozygous for the SNP, N6-methyladenosine (m 6 A)-related knock-out and HLA-DQ2 mice, and human samples from patients with CD. Results Individuals harbouring the risk allele had higher m 6 A methylation in the 5’UTR of XPO1 RNA, rendering greater XPO1 protein amounts that led to downstream nuclear factor kappa B (NFkB) activity and subsequent inflammation. Furthermore, gluten exposure increased overall m 6 A methylation in humans as well as in in vitro and in vivo models. Conclusion We identify a novel m 6 A-XPO1-NFkB pathway that is activated in CD patients. The findings will prompt the development of new therapeutic approaches directed at m 6 A proteins and XPO1, a target under evaluation for the treatment of intestinal disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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