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Enregistrement W3128960194 · doi:10.1111/eva.13203

Parentage‐based tagging combined with genetic stock identification is a cost‐effective and viable replacement for coded‐wire tagging in large‐scale assessments of marine Chinook salmon fisheries in British Columbia, Canada

2021· article· en· W3128960194 sur OpenAlexafffundabout
Terry D. Beacham, Colin Wallace, Kim Jonsen, Brenda McIntosh, John R. Candy, K. Ter Horst, Cheryl P. Lynch, D. M. Willis, Wilf Luedke, Lee Kearey, Éric Rondeau

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésChinook windFisheryOncorhynchusHatcheryStock assessmentFisheries managementPopulationBiologyThreatened speciesStock (firearms)FishingEcologyHabitatGeographyFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

, have been supplemented with hatchery propagation for over 50 years in support of increased ocean harvest, mitigation for hydroelectric development, and conservation of threatened populations. In Canada, the Wild Salmon Policy for Pacific salmon was established with the goal of maintaining and restoring healthy and diverse Pacific salmon populations, making conservation of wild salmon and their habitats the highest priority for resource management decision-making. For policy implementation, a new approach to the assessment and management of Chinook salmon and the associated hatchery production and fisheries management are needed. Implementation of genetic stock identification (GSI) and parentage-based tagging (PBT) for marine fisheries assessment may overcome problems associated with coded-wire tag-based (CWT) assessment and management of Chinook salmon fisheries, providing at a minimum information equivalent to that derived from the CWT program. GSI and PBT were used to identify Chinook salmon sampled in 2018 and 2019 marine fisheries (18,819 individuals genotyped) in British Columbia to specific conservation units (CU), populations, and broodyears. Individuals were genotyped at 391 single nucleotide polymorphisms via direct sequencing of amplicons. Very high accuracy of assignment to population and age (>99.5%) via PBT was observed for 1994 Chinook salmon of ages 2-4 years, with a 105,722-individual, 380-population baseline available for assignment. Application of a GSI-PBT system of identification to individuals in 2019 fisheries provided high-resolution estimates of stock composition, catch, and exploitation rate by CU or population, with fishery exploitation rates directly comparable to those provided by CWTs for 13 populations. GSI and PBT provide an alternate, cheaper, and more effective method in the assessment and management of Canadian-origin Chinook salmon relative to CWTs, and an opportunity for a genetics-based system to replace the current CWT system for salmon assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,824
Score d'incertitude au seuil0,853

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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