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Enregistrement W3129104360 · doi:10.1139/gen-2019-0213

DNA barcode analysis of the endangered green turtle (<i>Chelonia mydas</i>) in Mexico<sup>1</sup>

2021· article· en· W3129104360 sur OpenAlexvenueno aff
Fatima Yedith Camacho‐Sánchez, A. Alonso Aguirre, José Alberto Narváez-Zapata, Alan A. Zavala‐Norzagaray, César P. Ley‐Quiñónez, Héctor Hugo Acosta-Sánchez, Hervey Rodríguez‐González, Carlos Delgado-Trejo, Miguel Ángel Reyes‐López

Notice bibliographique

RevueGenome · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueTurtle Biology and Conservation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSistema Nacional de InvestigadoresComisión Nacional de Áreas Naturales ProtegidasConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaComisión de Operación y Fomento de Actividades Académicas, Instituto Politécnico NacionalInstituto Politécnico Nacional
Mots-clésBiologyHaplotypeTurtle (robot)Endangered speciesNucleotide diversityGenetic diversityDNA barcodingEcologyPopulationZoologyEvolutionary biologyGeneGeneticsAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) are realized through molecular approaches including DNA barcoding. We characterized the usefulness of COI DNA barcodes in green turtles in Mexico to better understand genetic divergence and other genetic parameters of this species. We analyzed 63 sequences, including 25 from green turtle field specimens collected from the Gulf of Mexico and from the Mexican Pacific and 38 already present in the Barcode of Life Data Systems (BOLD). A total of 13 haplotypes were identified with four novel haplotypes from the Pacific Ocean and three novel haplotypes from the Atlantic Ocean. Intraspecific distance values among COI gene sequences by two different models were 0.01, demonstrating that there is not a subdivision for green turtle species. Otherwise, the interspecific distance interval ranged from 0.07 to 0.13, supporting a clear subdivision among all sea turtle species. Haplotype and total nucleotide diversity values of the COI gene reflect a medium genetic diversity average. Green turtles of the Mexican Pacific showed common haplotypes to some Australian and Chinese turtles, but different from the haplotypes of the Mexican Atlantic. COI analysis revealed new haplotypes and confirmed that DNA barcodes were useful for evaluation of the population diversity of green turtles in Mexico.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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