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Enregistrement W3129163525 · doi:10.1109/access.2021.3052501

Mathematical Reconstruction of Patient-Specific Vascular Networks Based on Clinical Images and Global Optimization

2021· article· en· W3129163525 sur OpenAlexafffund
Jun-Hong Shen, Abdul Hannan Faruqi, Yifan Jiang, Nima Maftoon

Notice bibliographique

RevueIEEE Access · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMRI in cancer diagnosis
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesFields Institute for Research in Mathematical Sciences
Mots-clésComputer scienceMedical imagingArtificial intelligenceImage qualityIterative reconstructionComputer visionImage (mathematics)Data mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer is a major cause of death worldwide and becomes particularly threatening once it begins to metastasize. During metastasis, the blood vessels serve as pathways for cancerous cell transportation and hence are crucial for understanding cancer growth. Existing medical imaging modalities can provide 3-D contrast images of the vascular tissues but with limited quality and detailedness. A much-needed tool for cancer research is thus one that can reconstruct vascular networks from low-quality clinical images. To this end, we developed a computational framework that takes 3-D medical images as input and reconstructs complete, patient-specific vascular network models using a mathematical optimization procedure. Our framework extracts major vessels from the images and uses the organ geometry to select vessel termination points. Then, it generates the remainder network based on physiological optimality principles. Using the framework, we obtained a set of network models with over 3000 terminal segments from a brain MRA scan. We analyzed the Strahler order, vessel radius, and branch length distributions of the models, which match with actual human data. We also performed fluid dynamics simulation inside the reconstructed vessels and showed that the pressure and shear stress distributions agree with existing in vivo measurements. The qualitative and quantitative agreements in vessel morphometry and hemodynamics demonstrate the effectiveness of the framework. Our method bridges the gap between image-based vessel models, accuracy of which is limited by the resolution of clinical images, and hypothetical models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,575
Score d'incertitude au seuil0,494

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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