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Enregistrement W3129200854 · doi:10.3390/d13030103

Implications of Historical and Contemporary Processes on Genetic Differentiation of a Declining Boreal Songbird: The Rusty Blackbird

2021· article· en· W3129200854 sur OpenAlexafffundabout
Robert E. Wilson, Steven M. Matsuoka, Luke L. Powell, James A. Johnson, Dean W. Demarest, Diana Stralberg, Sarah A. Sonsthagen

Notice bibliographique

RevueDiversity · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of AlbertaNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesU.S. Fish and Wildlife ServiceU.S. Geological SurveyAlaska Department of Fish and GameUniversity of AlbertaMassachusetts Department of Fish and Game
Mots-clésEcologyBiological dispersalVicarianceGeographyHabitatRange (aeronautics)PopulationBiologyPhylogeographyPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The arrangement of habitat features via historical or contemporary events can strongly influence genomic and demographic connectivity, and in turn affect levels of genetic diversity and resilience of populations to environmental perturbation. The rusty blackbird (Euphagus carolinus) is a forested wetland habitat specialist whose population size has declined sharply (78%) over recent decades. The species breeds across the expansive North American boreal forest region, which contains a mosaic of habitat conditions resulting from active natural disturbance regimes and glacial history. We used landscape genomics to evaluate how past and present landscape features have shaped patterns of genetic diversity and connectivity across the species’ breeding range. Based on reduced-representation genomic and mitochondrial DNA, genetic structure followed four broad patterns influenced by both historical and contemporary forces: (1) an east–west partition consistent with vicariance during the last glacial maximum; (2) a potential secondary contact zone between eastern and western lineages at James Bay, Ontario; (3) insular differentiation of birds on Newfoundland; and (4) restricted regional gene flow among locales within western and eastern North America. The presence of genomic structure and therefore restricted dispersal among populations may limit the species’ capacity to respond to rapid environmental change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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