Implications of Historical and Contemporary Processes on Genetic Differentiation of a Declining Boreal Songbird: The Rusty Blackbird
Notice bibliographique
Résumé
The arrangement of habitat features via historical or contemporary events can strongly influence genomic and demographic connectivity, and in turn affect levels of genetic diversity and resilience of populations to environmental perturbation. The rusty blackbird (Euphagus carolinus) is a forested wetland habitat specialist whose population size has declined sharply (78%) over recent decades. The species breeds across the expansive North American boreal forest region, which contains a mosaic of habitat conditions resulting from active natural disturbance regimes and glacial history. We used landscape genomics to evaluate how past and present landscape features have shaped patterns of genetic diversity and connectivity across the species’ breeding range. Based on reduced-representation genomic and mitochondrial DNA, genetic structure followed four broad patterns influenced by both historical and contemporary forces: (1) an east–west partition consistent with vicariance during the last glacial maximum; (2) a potential secondary contact zone between eastern and western lineages at James Bay, Ontario; (3) insular differentiation of birds on Newfoundland; and (4) restricted regional gene flow among locales within western and eastern North America. The presence of genomic structure and therefore restricted dispersal among populations may limit the species’ capacity to respond to rapid environmental change.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».