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Enregistrement W3129472010 · doi:10.26577/iam.2020.v1.i1.01

Advices On Search And Critical Appraisal Of Biomedical Literature Part I, General Workflow

2020· article· en· W3129472010 sur OpenAlexaff
Nurlan Dauletbayev

Notice bibliographique

RevueInterdisciplinary Approaches to Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWorkflowCritical appraisalSubject (documents)Computer scienceSystematic reviewData scienceManagement scienceGrey literatureEngineering ethicsMEDLINEKnowledge managementMedicineAlternative medicineWorld Wide WebPolitical scienceEngineeringPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Both physician-scientists and practicing physicians regularly experience the need to browse, select, and critically appraise the current biomedical literature. There have been many useful reviews on each of the aforementioned topics. Still, having a unified and coherent workflow, feasible to fit into a busy clinical routine, would surely be appreciated by physicians. In addition, many of the aforementioned reviews have been written to target the audience in developed countries. In contrast, particularities of the access to the literature in developing countries (or economies in transition) have been addressed less frequently. Finally, new computational approaches, including machine translation and automated text mining, are rapidly emerging. These are indeed worthy addressing as the initiatives that could provide a great help to practicing physicians for rapid, yet comprehensive literature appraisals.The present review aims to provide physicians with the workflow and methodological recommen- dation on browsing, selecting, and critical appraisal of the biomedical literature, with the specific focus on patient- and disease-oriented publications.The review further aims to overcome the aforementioned limitations of the previously published literature on this subject.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,178
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,451
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,822
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1780,451
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0220,011
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0080,010
Science ouverte0,0050,007
Intégrité de la recherche0,0070,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0540,042

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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