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Enregistrement W3129575296 · doi:10.1002/cjp2.203

Practical considerations for optimising homologous recombination repair mutation testing in patients with metastatic prostate cancer

2021· review· en· W3129575296 sur OpenAlex
David González de Castro, Joaquı́n Mateo, Albrecht Stenzinger, Federico Rojo, Michelle Shiller, Alexander W. Wyatt, Frédérique Penault‐Llorca, Leonard G. Gomella, Rosalind A. Eeles, Anders Bjartell

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology Clinical Research · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesChugai PharmaceuticalGenentechAstellas PharmaNational Institute for Health and Care ResearchIncyteIpsenClovis OncologyRoyal Marsden NHS Foundation TrustUniversity of ChicagoBristol-Myers SquibbAstraZenecaAmerican Society of Clinical OncologySanofiLes Laboratories Pierre FabreAmgenPfizer
Mots-clésOlaparibMedicineProstate cancerPARP inhibitorMolecular diagnosticsBioinformaticsCancerComputational biologyOncologyInternal medicinePoly ADP ribose polymeraseGenePolymeraseBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Analysis of the genomic landscape of prostate cancer has identified different molecular subgroups with relevance for novel or existing targeted therapies. The recent approvals of the poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibitors olaparib and rucaparib in the metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) setting signal the need to embed molecular diagnostics in the clinical pathway of patients with mCRPC to identify those who can benefit from targeted therapies. Best practice guidelines in overall biospecimen collection and processing for molecular analysis are widely available for several tumour types. However, there is no standard protocol for molecular diagnostic testing in prostate cancer. Here, we provide a series of recommendations on specimen handling, sample pre-analytics, laboratory workflow, and testing pathways to maximise the success rates for clinical genomic analysis in prostate cancer. Early involvement of a multidisciplinary team of pathologists, urologists, oncologists, radiologists, nurses, molecular scientists, and laboratory staff is key to enable optimal workflow for specimen selection and preservation at the time of diagnosis so that samples are available for molecular analysis when required. Given the improved outcome of patients with mCRPC and homologous recombination repair gene alterations who have been treated with PARP inhibitors, there is an urgent need to incorporate high-quality genomic testing in the routine clinical pathway of these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,048
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,953
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,048
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,596
Tête enseignante GPT0,627
Écart entre enseignants0,031 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle