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Enregistrement W3130509169 · doi:10.1038/s41467-021-21279-0

POLRMT mutations impair mitochondrial transcription causing neurological disease

2021· article· en· W3130509169 sur OpenAlexafffund
Monika Oláhová, Bradley Peter, Zsolt Szilágyi, Héctor Díaz-Maldonado, Meenakshi Singh, Ewen W. Sommerville, Emma L. Blakely, Jack J. Collier, Emily Hoberg, Viktor Stránecký, Hana Hartmannová, Anthony J. Bleyer, Kim L. McBride, Sasigarn A. Bowden, Zuzana Korandová, Alena Pecinová, Hans‐Hilger Ropers, Kimia Kahrizi, Hossein Najmabadi, Mark A. Tarnopolsky, Lauren Brady, K. Nicole Weaver, Carlos E. Prada, Katrin Õunap, Monica H. Wojcik, Sander Pajusalu, Safoora B. Syeda, Lynn Pais, Elicia Estrella, Christine C. Bruels, Louis M. Kunkel, Peter B. Kang, Penelope E. Bonnen, Tomáš Mráček, Stanislav Kmoch, Gráinne S. Gorman, Maria Falkenberg, Claes M. Gustafsson, Robert W. Taylor

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcMaster UniversityMcMaster Children's Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEesti TeadusagentuurNational Eye InstituteEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institutes of HealthNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseLily FoundationChildren's Miracle Network HospitalsMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikySwedish Cancer FoundationMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchNational Human Genome Research InstituteGrantová Agentura, Univerzita KarlovaWellcome TrustBroad InstituteUniverzita Karlova v PrazeMcMaster UniversityMedical Research Council
Mots-clésMitochondrial DNABiologyGeneticsHypotoniaMitochondrial diseaseTranscription (linguistics)RNA polymerase IIGenePhenotypeHuman mitochondrial geneticsMitochondrionPolymerasePromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While >300 disease-causing variants have been identified in the mitochondrial DNA (mtDNA) polymerase γ, no mitochondrial phenotypes have been associated with POLRMT, the RNA polymerase responsible for transcription of the mitochondrial genome. Here, we characterise the clinical and molecular nature of POLRMT variants in eight individuals from seven unrelated families. Patients present with global developmental delay, hypotonia, short stature, and speech/intellectual disability in childhood; one subject displayed an indolent progressive external ophthalmoplegia phenotype. Massive parallel sequencing of all subjects identifies recessive and dominant variants in the POLRMT gene. Patient fibroblasts have a defect in mitochondrial mRNA synthesis, but no mtDNA deletions or copy number abnormalities. The in vitro characterisation of the recombinant POLRMT mutants reveals variable, but deleterious effects on mitochondrial transcription. Together, our in vivo and in vitro functional studies of POLRMT variants establish defective mitochondrial transcription as an important disease mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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