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Enregistrement W3130539992 · doi:10.21203/rs.3.rs-151220/v1

A comparative analysis of the InterVA model versus physician review in determining causes of neonatal deaths using verbal autopsy data from Nepal

2021· preprint· en· W3130539992 sur OpenAlexaff
Dinesh Dharel, Penny Dawson, Daniel A Adeyinka, Nazeem Muhajarine, Dinesh Neupane

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutopsy Techniques and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesUnited States Agency for International Development
Mots-clésAsphyxiaVerbal autopsyAutopsyMedicineCause of deathKappaCohen's kappaPediatricsPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<title>Abstract</title> <bold>Background: </bold>Verbal autopsy is a common method of ascertaining the cause of neonatal death in low resource settings where majority of causes of deaths remain unregistered. We aimed to compare the causes of neonatal deaths assigned by computer algorithm-based model, InterVA (Interpreting Verbal Autopsy) with the usual standard of Physician Review of Verbal Autopsy (PRVA) using the verbal autopsy data collected by Morang Innovative Neonatal Intervention (MINI) study in Nepal. <bold>Methods:</bold> MINI was a prospective community intervention study aimed at managing newborn illnesses at household level. Trained field staff conducted a verbal autopsy of all neonatal deaths during the study period. The cause of death was assigned by two pediatricians, and by using InterVA version 5. Cohen's kappa coefficient was calculated to compare the agreement between InterVA and PRVA assigned proximate cause of death, using STATATM software version 16.1. <bold>Results: </bold>Among 381 verbal autopsies for neonatal deaths, only 311 (81.6%) were assigned one of birth asphyxia, neonatal infection, congenital anomalies or preterm-related complications as the proximate cause of death by both InterVA and PRVA, while the remaining 70 (18.4%) were assigned other or non-specific causes. The overall agreement between InterVA and PRVA-assigned cause of death categories was moderate (66.5% agreement, kappa=0.47). Moderate agreement was observed for neonatal infection (kappa=0.48) and congenital malformations (kappa=0.49), while it was fair for birth asphyxia (kappa=0.39), and preterm-related complications (kappa=0.31); but there was only slight agreement for neonatal sepsis (kappa=0.19) and neonatal pneumonia (kappa=0.16) as specific causes of death within neonatal infections. <bold>Conclusions:</bold> We observed moderate overall agreement for major categories of causes of neonatal death assigned by InterVA and PRVA. The moderate agreement was sustained for the classification of neonatal infection but poor for neonatal sepsis and neonatal pneumonia as distinct categories of neonatal infection. Further studies should investigate the comparative effectiveness of an updated version of InterVA with the current standard of assigning the cause of neonatal death through longitudinal and experimental designs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,387
Tête enseignante GPT0,533
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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