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Enregistrement W3130700206 · doi:10.3389/fpsyt.2021.598518

Predicting Brain Age at Slice Level: Convolutional Neural Networks and Consequences for Interpretability

2021· article· en· W3130700206 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Psychiatry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterpretabilityNeuroimagingBrain agingDementiaWhite matterPsychologyConvolutional neural networkAging brainMagnetic resonance imagingCognitionNeuroscienceCognitive psychologyMedicineDiseaseArtificial intelligenceComputer sciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Problem: Chronological aging in later life is associated with brain degeneration processes and increased risk for disease such as stroke and dementia. With a worldwide tendency of aging populations and increased longevity, mental health, and psychiatric research have paid increasing attention to understanding brain-related changes of aging. Recent findings suggest there is a brain age gap (a difference between chronological age and brain age predicted by brain imaging indices); the magnitude of the gap may indicate early onset of brain aging processes and disease. Artificial intelligence has allowed for a narrowing of the gap in chronological and predicted brain age. However, the factors that drive model predictions of brain age are still unknown, and there is not much about these factors that can be gleaned from the black-box nature of machine learning models. The goal of the present study was to test a brain age regression approach that is more amenable to interpretation by researchers and clinicians. Methods: Using convolutional neural networks we trained multiple regressor models to predict brain age based on single slices of magnetic resonance imaging, which included gray matter- or white matter-segmented inputs. We evaluated the trained models in all brain image slices to generate a final prediction of brain age. Unlike whole-brain approaches to classification, the slice-level predictions allows for the identification of which brain slices and associated regions have the largest difference between chronological and neuroimaging-derived brain age. We also evaluated how model predictions were influenced by slice index and plane, participant age and sex, and MRI data collection site. Results: The results show, first, that the specific slice used for prediction affects prediction error (i.e., difference between chronological age and neuroimaging-derived brain age); second, the MRI site-stratified separation of training and test sets removed site effects and also minimized sex effects; third, the choice of MRI slice plane influences the overall error of the model. Conclusion: Compared to whole brain-based predictive models of neuroimaging-derived brain age, slice-based approach improves the interpretability and therefore the reliability of the prediction of brain age using MRI data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,804
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle