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Enregistrement W3130735504 · doi:10.1038/s41467-021-21408-9

Lysates of Methylococcus capsulatus Bath induce a lean-like microbiota, intestinal FoxP3+RORγt+IL-17+ Tregs and improve metabolism

2021· article· en· W3130735504 sur OpenAlexafffund
Benjamin A. H. Jensen, Jacob Bak Holm, Ida Larsen, Nicole von Burg, Stefanie Derer, Si Brask Sonne, Simone Isling Pærregaard, Mads V. Damgaard, Stine Indrelid, Aymeric Rivollier, Anne-Laure Agrinier, Karolina Sulek, Yke Jildouw Arnoldussen, Even Fjære, André Marette, Inga Leena Angell, Knut Rudi, Jonas T. Treebak, Lise Madsen, Caroline Piercey Åkesson, William W. Agace, Christian Sina, Charlotte R. Kleiveland, Karsten Kristiansen, Tor Lea

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNorges ForskningsrådCanada First Research Excellence FundNovo Nordisk FondenNovo NordiskH. Lundbeck A/SLundbeckfonden
Mots-clésFOXP3MetabolismChemistryMicrobiologyImmunologyBiologyBiochemistryImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Interactions between host and gut microbial communities are modulated by diets and play pivotal roles in immunological homeostasis and health. We show that exchanging the protein source in a high fat, high sugar, westernized diet from casein to whole-cell lysates of the non-commensal bacterium Methylococcus capsulatus Bath is sufficient to reverse western diet-induced changes in the gut microbiota to a state resembling that of lean, low fat diet-fed mice, both under mild thermal stress (T22 °C) and at thermoneutrality (T30 °C). Concomitant with microbiota changes, mice fed the Methylococcus -based western diet exhibit improved glucose regulation, reduced body and liver fat, and diminished hepatic immune infiltration. Intake of the Methylococcu -based diet markedly boosts Parabacteroides abundances in a manner depending on adaptive immunity, and upregulates triple positive (Foxp3 + RORγt + IL-17 + ) regulatory T cells in the small and large intestine. Collectively, these data point to the potential for leveraging the use of McB lysates to improve immunometabolic homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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