Evaluating node embeddings of complex networks
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Graph embedding is a transformation of nodes of a graph into a set of vectors. A good embedding should capture the graph topology, node-to-node relationship and other relevant information about the graph, its subgraphs and nodes. If these objectives are achieved, an embedding is a meaningful, understandable, compressed representations of a network that can be used for other machine learning tools such as node classification, community detection or link prediction. In this article, we do a series of extensive experiments with selected graph embedding algorithms, both on real-world networks as well as artificially generated ones. Based on those experiments, we formulate the following general conclusions. First, we confirm the main problem of node embeddings that is rather well-known to practitioners but less documented in the literature. There exist many algorithms available to choose from which use different techniques and have various parameters that may be tuned, the dimension being one of them. One needs to ensure that embeddings describe the properties of the underlying graphs well but, as our experiments confirm, it highly depends on properties of the network at hand and the given application in mind. As a result, selecting the best embedding is a challenging task and very often requires domain experts. Since investigating embeddings in a supervised manner is computationally expensive, there is a need for an unsupervised tool that is able to select a handful of promising embeddings for future (supervised) investigation. A general framework, introduced recently in the literature and easily available on GitHub repository, provides one of the very first tools for an unsupervised graph embedding comparison by assigning the ‘divergence score’ to embeddings with a goal of distinguishing good from bad ones. We show that the divergence score strongly correlates with the quality of embeddings by investigating three main applications of node embeddings: node classification, community detection and link prediction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,031 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».