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Enregistrement W3131452986 · doi:10.1038/s41436-020-01075-9

DLG4-related synaptopathy: a new rare brain disorder

2021· article· en· W3131452986 sur OpenAlexaff
Agustí Rodríguez‐Palmero, Melissa M. Boerrigter, David Gómez‐Andrés, Kimberly A. Aldinger, Íñigo Marcos‐Alcalde, Bernt Popp, David B. Everman, Alysia Kern Lovgren, Stéphanie Arpin, Vahid Bahrambeigi, Gea Beunders, Anne‐Marie Bisgaard, Victoria A. Bjerregaard, Ange‐Line Bruel, Thomas D. Challman, Benjamin Cogné, Christine Coubes, de Man, Anne‐Sophie Denommé‐Pichon, Thomas J. Dye, Frances Elmslie, Lars Feuk, Sixto García‐Miñáur, Tracy S. Gertler, Elisa Giorgio, Nicolas Gruchy, Tobias B. Haack, Chad Haldeman‐Englert, Bjørn Ivar Haukanes, Juliane Hoyer, Anna Hurst, Bertrand Isidor, Maria Soller, Sulagna Kushary, Malin Kvarnung, Yuval E. Landau, Kathleen A. Leppig, Anna Lindstrand, Lotte Kleinendorst, Alex MacKenzie, Giorgia Mandrile, Bryce A. Mendelsohn, Setareh Moghadasi, Jenny E.V. Morton, Sébastien Moutton, Amelie J. Müller, Melanie O’Leary, Marta Pacio‐Míguez, María Palomares‐Bralo, Sumit Parikh, Rolph Pfundt, Ben Pode‐Shakked, Anita Rauch, Elena Repnikova, Anya Revah‐Politi, Meredith J. Ross, Claudia Ruivenkamp, Elisabeth Sarrazin, Juliann M. Savatt, Agatha Schlüter, Bitten Schönewolf‐Greulich, Zohra Shad, Charles Shaw‐Smith, Joseph T.C. Shieh, M Shohat, Stephanie Spranger, Heidi Thiese, Frédéric Tran Mau‐Them, Bregje W.M. van Bon, Ineke van der Burgt, Ingrid M.B.H. van de Laar, Esmée van Drie, Mieke M. van Haelst, Conny M.A. van Ravenswaaij‐Arts, Edgard Verdura, Antonio Vitobello, Stephan Waldmüller, Sharon Whiting, Christiane Zweier, Carlos E. Prada, Bert B.A. de Vries, William B. Dobyns, Simone Frizell Reiter, Paulino Gómez‐Puertas, Aurora Pujol, Zeynep Tümer

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésNeuroscienceMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Postsynaptic density protein-95 (PSD-95), encoded by DLG4, regulates excitatory synaptic function in the brain. Here we present the clinical and genetic features of 53 patients (42 previously unpublished) with DLG4 variants. METHODS: The clinical and genetic information were collected through GeneMatcher collaboration. All the individuals were investigated by local clinicians and the gene variants were identified by clinical exome/genome sequencing. RESULTS: The clinical picture was predominated by early onset global developmental delay, intellectual disability, autism spectrum disorder, and attention deficit-hyperactivity disorder, all of which point to a brain disorder. Marfanoid habitus, which was previously suggested to be a characteristic feature of DLG4-related phenotypes, was found in only nine individuals and despite some overlapping features, a distinct facial dysmorphism could not be established. Of the 45 different DLG4 variants, 39 were predicted to lead to loss of protein function and the majority occurred de novo (four with unknown origin). The six missense variants identified were suggested to lead to structural or functional changes by protein modeling studies. CONCLUSION: The present study shows that clinical manifestations associated with DLG4 overlap with those found in other neurodevelopmental disorders of synaptic dysfunction; thus, we designate this group of disorders as DLG4-related synaptopathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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