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Enregistrement W3131479422 · doi:10.1038/s41467-021-21181-9

Reentrant liquid condensate phase of proteins is stabilized by hydrophobic and non-ionic interactions

2021· article· en· W3131479422 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchDirectorate for Biological SciencesKing's College LondonHorizon 2020 Framework ProgrammeUniversity of CambridgeEngineering and Physical Sciences Research CouncilAlzheimer SocietyWellcome TrustAlzheimer's SocietyWinston Churchill Foundation of the United StatesConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementEuropean CommissionFondation Brain CanadaALS Society of Canada
Mots-clésChemical physicsPhase (matter)ChemistrySalt (chemistry)BiophysicsHydrophobic effectIonic bondingPhase transitionDruggabilityHalobacterium salinarumCondensationReentrancyFunction (biology)IonPhysicsOrganic chemistryBiochemistryMembraneThermodynamicsBacteriorhodopsinBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Liquid-liquid phase separation of proteins underpins the formation of membraneless compartments in living cells. Elucidating the molecular driving forces underlying protein phase transitions is therefore a key objective for understanding biological function and malfunction. Here we show that cellular proteins, which form condensates at low salt concentrations, including FUS, TDP-43, Brd4, Sox2, and Annexin A11, can reenter a phase-separated regime at high salt concentrations. By bringing together experiments and simulations, we demonstrate that this reentrant phase transition in the high-salt regime is driven by hydrophobic and non-ionic interactions, and is mechanistically distinct from the low-salt regime, where condensates are additionally stabilized by electrostatic forces. Our work thus sheds light on the cooperation of hydrophobic and non-ionic interactions as general driving forces in the condensation process, with important implications for aberrant function, druggability, and material properties of biomolecular condensates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle