Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML
Notice bibliographique
Résumé
In acute myeloid leukemia (AML), molecular heterogeneity across patients constitutes a major challenge for prognosis and therapy. AML with NPM1 mutation is a distinct genetic entity in the revised World Health Organization classification. However, differing patterns of co-mutation and response to therapy within this group necessitate further stratification. Here we report two distinct subtypes within NPM1 mutated AML patients, which we label as primitive and committed based on the respective presence or absence of a stem cell signature. Using gene expression (RNA-seq), epigenomic (ATAC-seq) and immunophenotyping (CyToF) analysis, we associate each subtype with specific molecular characteristics, disease differentiation state and patient survival. Using ex vivo drug sensitivity profiling, we show a differential drug response of the subtypes to specific kinase inhibitors, irrespective of the FLT3-ITD status. Differential drug responses of the primitive and committed subtype are validated in an independent AML cohort. Our results highlight heterogeneity among NPM1 mutated AML patient samples based on stemness and suggest that the addition of kinase inhibitors to the treatment of cases with the primitive signature, lacking FLT3-ITD, could have therapeutic benefit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».