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Enregistrement W3131869615 · doi:10.1093/femsec/fiab034

Soil microbial communities influencing organic phosphorus mineralization in a coastal dune chronosequence in New Zealand

2021· article· en· W3131869615 sur OpenAlexafffund
Jonathan R. Gaiero, Micaela Tosi, Elizabeth Bent, Gustavo Boitt, Kamini Khosla, Benjamin L. Turner, Alan E. Richardson, Leo M. Condron, Kari E. Dunfield

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoil Carbon and Nitrogen Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesLincoln UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésChronosequenceBiologyMineralization (soil science)PhosphorusEcologyEnvironmental chemistryAgronomySoil water

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Haast chronosequence in New Zealand is an ∼6500-year dune formation series, characterized by rapid podzol development, phosphorus (P) depletion and a decline in aboveground biomass. We examined bacterial and fungal community composition within mineral soil fractions using amplicon-based high-throughput sequencing (Illumina MiSeq). We targeted bacterial non-specific acid (class A, phoN/phoC) and alkaline (phoD) phosphomonoesterase genes and quantified specific genes and transcripts using real-time PCR. Soil bacterial diversity was greatest after 4000 years of ecosystem development and associated with an increased richness of phylotypes and a significant decline in previously dominant taxa (Firmicutes and Proteobacteria). Soil fungal communities transitioned from predominantly Basidiomycota to Ascomycota along the chronosequence and were most diverse in 290- to 392-year-old soils, coinciding with maximum tree basal area and organic P accumulation. The Bacteria:Fungi ratio decreased amid a competitive and interconnected soil community as determined by network analysis. Overall, soil microbial communities were associated with soil changes and declining P throughout pedogenesis and ecosystem succession. We identified an increased dependence on organic P mineralization, as found by the profiled acid phosphatase genes, soil acid phosphatase activity and function inference from predicted metagenomes (PICRUSt2).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,827
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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