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Enregistrement W3131983771 · doi:10.1139/cjm-2020-0070

Temperature affects substrate-associated bacterial composition during <i>Ganoderma lucidum</i> hyphal growth

2021· article· en· W3131983771 sur OpenAlexvenueno aff
Bo Zhang, Jie Zhou, Xiaolin Li, Lei Ye, Dinghong Jia, Bingcheng Gan, Wei Tan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFirmicutesProteobacteriaBiologyMyceliumGanoderma lucidumBotanyFood scienceFungusBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The growth of the well-known fungus Ganoderma lucidum is influenced by temperature, which has an impact on the associated microbial structure in the substrate. In this study, we analyzed the bacterial diversity of the substrate at different temperatures using next-generation sequencing technology. A total of 513 733 sequences from 15 samples were assigned to 19 bacterial phyla. The samples were dominated by Proteobacteria, followed by Firmicutes; the 2 phyla exhibited opposite changes with elevated temperature. Bacterial genera showed different abundances at different temperatures, in which Sediminibacterium maintained a stable abundance below 40 °C, while Ochrobactrum and Rhodococcus were enriched with elevated temperature and both showed their highest abundances at 40 °C. Functional prediction uncovered 39 identified KEGG pathways, and bacterial genes involved in the membrane transport pathway exhibited the highest abundance subject to heat (40 °C) during the growth of G. lucidum. In general, our findings illustrated the influence of temperatures on G. lucidum mycelial morphology and the bacterial community in the substrate, and the results will facilitate cultivation of this fungus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,456

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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