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Enregistrement W3132035473 · doi:10.1002/leg3.75

Recent advances in faba bean genetic and genomic tools for crop improvement

2021· review· en· W3132035473 sur OpenAlexafffund
Hamid Khazaeı, Donal M. O’Sullivan, Frederick L. Stoddard, Kedar Adhikari, Jeffrey G. Paull, Alan H. Schulman, Stig Uggerhøj Andersen, Albert Vandenberg

Notice bibliographique

RevueLegume Science · 2021
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological SciencesInnovationsfondenGrains Research and Development CorporationBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilSaskatchewan Pulse GrowersAcademy of FinlandWestern Grains Research Foundation
Mots-clésCropBiologyBiotechnologyAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L.), a member of the Fabaceae family, is one of the important food legumes cultivated in cool temperate regions. It holds great importance for human consumption and livestock feed because of its high protein content, dietary fibre, and nutritional value. Major faba bean breeding challenges include its mixed breeding system, unknown wild progenitor, and genome size of ~13 Gb, which is the largest among diploid field crops. The key breeding objectives in faba bean include improved resistance to biotic and abiotic stress and enhanced seed quality traits. Regarding quality traits, major progress on reduction of vicine-convicine and seed coat tannins, the main anti-nutritional factors limiting faba bean seed usage, have been recently achieved through gene discovery. Genomic resources are relatively less advanced compared with other grain legume species, but significant improvements are underway due to a recent increase in research activities. A number of bi-parental populations have been constructed and mapped for targeted traits in the last decade. Faba bean now benefits from saturated synteny-based genetic maps, along with next-generation sequencing and high-throughput genotyping technologies that are paving the way for marker-assisted selection. Developing a reference genome, and ultimately a pan-genome, will provide a foundational resource for molecular breeding. In this review, we cover the recent development and deployment of genomic tools for faba bean breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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