Human basigin (CD147) does not directly interact with SARS-CoV-2 spike glycoprotein
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Basigin, or CD147, has been reported as a co-receptor used by SARS-CoV-2 to invade host cells. Basigin also has a well-established role in Plasmodium falciparum malaria infection of human erythrocytes where it is bound by one of the parasite’s invasion ligands, reticulocyte binding protein homolog 5 (RH5). Here, we sought to validate the claim that the receptor binding domain (RBD) of SARS-CoV-2 spike glycoprotein can form a complex with basigin, using RH5-basigin as a positive control. Using recombinantly expressed proteins, size exclusion chromatography and surface plasmon resonance, we show that neither RBD nor full-length spike glycoprotein bind to recombinant human basigin (either expressed in E. coli or mammalian cells). Given the immense interest in SARS-CoV-2 therapeutic targets, we would caution the inclusion of basigin in this list on the basis of its reported direct interaction with SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Importance Reducing the mortality and morbidity associated with COVID-19 remains a global health priority. Critical to these efforts is the identification of host factors that are essential to viral entry and replication. Basigin, or CD147, was previously identified as a possible therapeutic target based on the observation that it may act as a co-receptor for SARS-COV-2, binding to the receptor binding domain of the spike protein. Here, we show that there is no direct interaction between the RBD and basigin, casting doubt on its role as a co-receptor and plausibility as a therapeutic target.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».