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Enregistrement W3132443982 · doi:10.11648/j.ejb.20200802.18

Determination of Endogenous Radioresistance Biomarkers on HeLa Cells

2020· article· en· W3132443982 sur OpenAlexaff
Mamadou Soumboundou, Marie Thérèse Aloy, Macoura Gadji, Céline Malésys, Gora Mbaye, Ahmadou Dem, Mounibé Diarra, Claire Rodriguez‐Lafrasse

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biophysics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of ManitobaResearch Institute in Oncology and HematologyCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeLaRadioresistanceCancer researchHypoxia (environmental)Molecular biologyBiologyCell culturePathologyChemistryCellMedicineOxygenBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Genes such as carbonic anhydrase IX (CAIX), hypoxia inducible factor-1 (HIF-1) and vascular endothelial growth factor (VEGF) have been suggested as hypoxic biomarkers in cancer. Indeed, these endogenous biomarkers have been shown to have stronger prognostic value response after treatment by irradiation. However, inconsistent results suggest that factors other than oxygen influence their expression. This present study deciphers the level of expression of different radioresistance biomarkers in both normoxia and hypoxia conditions followed by irradiation of human ovarian tumor cell lines (uterine cervix squamous cell carcinoma (HeLa). HeLa cells were submitted to hypoxia (1% O2) conditions in a Thermo Scientific Heracell i CO2 incubator. The cells were subjected to two doses 4-10 Gy irradiation and re-incubate in their starting conditions for 4 hours, then fixed in 4% paraformaldehyde for 20 min. Protein expressions were assessed by immunocytochemistry staining and fluorescent images were captured by a Axio Imager Z1 fluorescence microscope with oil immersion lens at 63× magnification. In normoxia conditions there was no modification of the level of expression of the CAIX after irradiation. However, an increasing expression level of VEGF was noted. The level of expression of HIF-1 in normoxia was low compared to the other two proteins (CAIX and VEGF). Hypoxia conditions at 2% resulted in a low expression of CAIX and VEGF before and after irradiation at 10 Gy in HeLa cells. HIF-1 had a maximum expression level compared to CAIX and VEGF at 2% oxygen after irradiation in HeLa cells. As tumor hypoxia occurs in a deprived microenvironment, other environmental factors such as irradiation might interact with the effect of low oxygen concentration on gene expression. This study shows that irradiation of HeLa cells has a profound influence on the oxygen dependent induction of certain endogenous hypoxic markers as HIF-1, CAIX, and VEGF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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