Fetal gut colonization: meconium does not have a detectable microbiota before birth
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Microbial colonization of the human intestine impacts host metabolism and immunity, however when colonization occurs is unclear. Although numerous studies have reported bacterial DNA in first-pass meconium samples, these samples are collected hours to days after birth. We investigated whether bacteria could be detected in meconium prior to birth. Fetal meconium (n = 20) was collected by rectal swab during elective breech Cesarean sections without labour prior to antibiotics and compared to technical and procedural controls (n = 5), first-pass meconium (neonatal meconium; n = 14), and infant stool (n = 25). Unlike first-pass meconium, no microbial signal distinct from negative controls was detected in fetal meconium by 16S rRNA gene sequencing. Additionally, positive aerobic (n = 10 of 20) and anaerobic (n = 12 of 20) clinical cultures of fetal meconium (13 of 20 samples positive in at least one culture) were identified as likely skin contaminants, most frequently Staphylococcus epidermidis , and not detected by sequencing in most samples (same genera detected by culture and sequencing in 2 of 13 samples with positive culture). We conclude that fetal gut colonization does not occur before birth, and that microbial profiles of neonatal meconium reflect populations acquired during and after birth.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».