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Enregistrement W3132608056 · doi:10.1016/j.conctc.2021.100749

Improving data quality in observational research studies: Report of the Cure Glomerulonephropathy (CureGN) network

2021· article· en· W3132608056 sur OpenAlexaffabout
Brenda W. Gillespie, Louis‐Philippe Laurin, Dawn Zinsser, Richard Lafayette, Maddalena Marasà, Scott E. Wenderfer, Suzanne Vento, Caroline J. Poulton, Laura Barisoni, Jarcy Zee, Margaret Helmuth, Francesca Lugani, Margret Kamel, Peg Hill-Callahan, Stephen M. Hewitt, Laura Mariani, William E. Smoyer, Larry A. Greenbaum, Debbie S. Gipson, Bruce Robinson, Ali G. Gharavi, Lisa M. Guay‐Woodford, Howard Trachtman

Notice bibliographique

RevueContemporary Clinical Trials Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésObservational studyData qualityCenter of excellenceComputer scienceQuality (philosophy)Data collectionData scienceExcellenceMedicineDatabaseOperations managementEngineeringPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: High data quality is of crucial importance to the integrity of research projects. In the conduct of multi-center observational cohort studies with increasing types and quantities of data, maintaining data quality is challenging, with few published guidelines. METHODS: The Cure Glomerulonephropathy (CureGN) Network has established numerous quality control procedures to manage the 70 participating sites in the United States, Canada, and Europe. This effort is supported and guided by the activities of several committees, including Data Quality, Recruitment and Retention, and Central Review, that work in tandem with the Data Coordinating Center to monitor the study. We have implemented coordinator training and feedback channels, data queries of questionable or missing data, and developed performance metrics for recruitment, retention, visit completion, data entry, recording of patient-reported outcomes, collection, shipping and accessing of biological samples and pathology materials, and processing, cataloging and accessing genetic data and materials. RESULTS: We describe the development of data queries and site Report Cards, and their use in monitoring and encouraging excellence in site performance. We demonstrate improvements in data quality and completeness over 4 years after implementing these activities. We describe quality initiatives addressing specific challenges in collecting and cataloging whole slide images and other kidney pathology data, and novel methods of data quality assessment. CONCLUSIONS: This paper reports the CureGN experience in optimizing data quality and underscores the importance of general and study-specific data quality initiatives to maintain excellence in the research measures of a multi-center observational study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,375
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,517
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,625
Score d'incertitude au seuil0,771

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3750,517
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,009
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0050,011
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,991
Tête enseignante GPT0,799
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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