Molecular and Cellular Biomarkers of COVID-19 Prognosis: Protocol for the Prospective Cohort TARGET Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Since the beginning of the COVID-19 pandemic, the world's attention has been focused on better understanding the relation between the human host and the SARS-CoV-2 virus, as its action has led to hundreds of thousands of deaths. OBJECTIVE: In this context, we decided to study certain consequences of the abundant cytokine release over the innate and adaptive immune systems, inflammation, and hemostasis, comparing mild and severe forms of COVID-19. METHODS: To accomplish these aims, we will analyze demographic characteristics, biochemical tests, immune biomarkers, leukocyte phenotyping, immunoglobulin profile, hormonal release (cortisol and prolactin), gene expression, thromboelastometry, neutralizing antibodies, metabolic profile, and neutrophil function (reactive oxygen species production, neutrophil extracellular trap production, phagocytosis, migration, gene expression, and proteomics). A total of 200 reverse transcription polymerase chain reaction-confirmed patients will be enrolled and divided into two groups: mild/moderate or severe/critical forms of COVID-19. Blood samples will be collected at different times: at inclusion and after 9 and 18 days, with an additional 3-day sample for severe patients. We believe that this information will provide more knowledge for future studies that will provide more robust and useful clinical information that may allow for better decisions at the front lines of health care. RESULTS: The recruitment began in June 2020 and is still in progress. It is expected to continue until February 2021. Data analysis is scheduled to start after all data have been collected. The coagulation study branch is complete and is already in the analysis phase. CONCLUSIONS: This study is original in terms of the different parameters analyzed in the same sample of patients with COVID-19. The project, which is currently in the data collection phase, was approved by the Brazilian Committee of Ethics in Human Research (CAAE 30846920.7.0000.0008). TRIAL REGISTRATION: Brazilian Registry of Clinical Trials RBR-62zdkk; https://ensaiosclinicos.gov.br/rg/RBR-62zdkk. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/24211.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,019 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,032 | 0,010 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».