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Enregistrement W3133126610 · doi:10.1094/pdis-09-20-1938-pdn

First Report of <i>Leptosphaeria biglobosa</i> ‘brassicae’ Causing Blackleg on <i>Brassica rapa</i> subsp. <i>pekinensis</i> in China

2021· article· en· W3133126610 sur OpenAlexaff
Changqing Yu, Yingtian Deng, Mingde Wu, Gary Peng, Guoqing Li

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBlacklegPycnidiumLeptosphaeria maculansBrassica rapaSpotsHorticultureConidiumBrassicaPotato dextrose agarMyceliumBotanyBlack spotAgar

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chinese cabbage [Brassica rapa L. subsp. pekinensis (Lour.) Hanelt] is a major leafy vegetable crop grown in China and eastern Asia (Fordham and Hadley 2003). In December 2018, black leg symptoms were observed on of "Qingza No.3" of Chinese cabbage during harvest, Chibi (29°46'37.38''N, 114°05'6.88''E), Hubei, China. Symptoms were first noted in late Nov. as black spots on leaf petioles and basal stems. Then, black spots enlarged as oval or irregular-shaped grayish lesions. Finally, lesions enlarged and coalesced with black pycnidia were observed, and some diseased leaves became blighted. The disease incidence was about 80% in three fields surveyed (~2 ha in total). Diseased plant tissues were surface-sterilized, and incubated on potato dextrose agar (PDA) plates at 20°C for 4 days. Three fungal isolates, namely EP9-19, EP9-22 and EP9-26, were obtained from five of the diseased samples; all produced fluffy, white aerial mycelia and a yellow pigment on PDA. After 14 days, black-brown and globose pycnidia were produced, approximately 150 μm in diameter (n = 50). In addition, pink pycnidiospore ooze was observed on the top of pycnidium after 20-day culturing on a V8-juice (20%) agar. Conidia were cylindrical and hyaline, with the mean size of 4.6 × 2.7 μm (n = 50). Two fungal species have been reported to cause blackleg on Brassica crops (Williams and Fitt 1999), i.e. Leptosphaeria maculans and L. biglobosa. The former is much more destructive, but is not present in China. These isolates had morphological characteristics matching those of L. biglobosa (Williams and Fitt 1999). The genomic DNA of isolate EP9-22 was extracted and sequenced for its actin, β-tubulin and the internal transcribed spacer (ITS) region of ribosomal DNA as described by Vincenot et al. (2008). Sequences of ITS (GenBank accession no. MN238766), actin (MN242213) and β-tubulin (MN242214) for isolate EP9-22 showed 100%, 99.67%, and 97.93% identity to the corresponding regions of L. biglobosa 'brassicae' strain IBCN89 (Vincenot et al. 2008). In addition, the phylogenetic analysis also indicated that isolate EP9-22 belonged to L. biglobosa 'brassicae'. The pathogenicity test was performed according to established protocols (Balesdent et al., 2005). Cotyledons of the 15-day-old Chinese cabbage seedlings (cultivars Xiaoza No.55 and Hualiangzao No.5) were wound inoculated with 10 μl pycnidiospore suspension (1 × 107 conidia/ml) of the three isolates, with 20 cotyledons per isolate, respectively, and 20 cotyledons wound inoculated with sterile water served as a control group. The treated seedlings were maintained at 20°C and 100% relative humidity with a 12-h photoperiod. The experiment was repeated twice. At 7 days after inoculation, necrotic lesions became visible surrounding inoculation sites for the three isolates, while the control group remained healthy. Fungal isolates showing a similar colony morphology to the originals were re-isolated from ten diseased cotyledons but not from the control cotyledons. Based on these results, L. biglobosa 'brassicae' was shown to be the causal agent of blackleg on Chinese cabbage in China. We believe that this disease has historically often been misidentified as 'anthracnose' by local famers. The threat from L. biglobosa to the production of Chinese cabbage has been assessed. This accurate identification of the causal pathogen is a critical first step towards the development of disease management strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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