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Enregistrement W3133183798 · doi:10.5858/arpa.2020-0579-oa

Pathologist Concordance for Ovarian Carcinoma Subtype Classification and Identification of Relevant Histologic Features Using Microscope and Whole Slide Imaging

2021· article· en· W3133183798 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceIdentification (biology)Ovarian carcinomaCarcinomaMicroscopeOvarian cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT.—: Despite several studies focusing on the validation of whole slide imaging (WSI) across organ systems or subspecialties, the use of WSI for specific primary diagnosis tasks has been underexamined. OBJECTIVE.—: To assess pathologist performance for the histologic subtyping of individual sections of ovarian carcinomas using a light microscope and WSI. DESIGN.—: A panel of 3 experienced gynecologic pathologists provided reference subtype diagnoses for 212 histologic sections from 109 ovarian carcinomas based on optical microscopy review. Two additional attending pathologists provided diagnoses and also identified the presence of a set of 8 histologic features important for ovarian tumor subtyping. Two experienced gynecologic pathologists and 2 fellows reviewed the corresponding WSI images for subtype classification and feature identification. RESULTS.—: Across pathologists specialized in gynecologic pathology, concordance with the reference diagnosis for the 5 major ovarian carcinoma subtypes was significantly higher for a pathologist reading on a microscope than each of 2 pathologists reading on WSI. Differences were primarily due to more frequent classification of mucinous carcinomas as endometrioid with WSI. Pathologists had generally low agreement in identifying histologic features important to ovarian tumor subtype classification with either an optical microscopy or WSI. This result suggests the need for refined histologic criteria for identifying such features. Interobserver agreement was particularly low for identifying intracytoplasmic mucin with WSI. Inconsistencies in evaluating nuclear atypia and mitoses with WSI were also observed. CONCLUSIONS.—: Further research is needed to specify the reasons for these diagnostic challenges and to inform users and manufacturers of WSI technology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,026
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,052
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,137

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0260,052
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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