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Enregistrement W3133245738 · doi:10.21037/atm-20-4498

The Anaesthetic Biobank of Cerebrospinal fluid: a unique repository for neuroscientific biomarker research

2021· article· en· W3133245738 sur OpenAlexaboutno aff
Celien Tigchelaar, Sawal D. Atmosoerodjo, Martijn van Faassen, Klaas J. Wardenaar, Peter Paul De Deyn, Robert A. Schoevers, Ido P. Kema, Anthony Absalom

Notice bibliographique

RevueAnnals of Translational Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversitair Medisch Centrum GroningenRijksuniversiteit Groningen
Mots-clésMedicineCerebrospinal fluidBiobankBiomarkerDepression (economics)AnxietyAnesthesiaInternal medicineBioinformaticsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The pathophysiology of numerous central nervous system disorders remains poorly understood. Biomarker research using cerebrospinal fluid (CSF) is a promising way to illuminate the neurobiology of neuropsychiatric disorders. CSF biomarker studies performed so far generally included patients with neurodegenerative diseases without an adequate control group. The Anaesthetic Biobank of Cerebrospinal fluid (ABC) was established to address this. The aims are to (I) provide healthy-control reference values for CSF-based biomarkers, and (II) to investigate associations between CSF-based candidate biomarkers and neuropsychiatric symptoms. METHODS: In this cross-sectional study, we collect and store CSF and blood from adult patients undergoing spinal anaesthesia for elective surgery. Blood (20.5 mL) is collected during intravenous cannulation and CSF (10 mL) is aspirated prior to intrathecal local anaesthetic injection. A portion of the blood and CSF is sent for routine laboratory analyses, the remaining material is stored at -80 °C. Relevant clinical, surgical and anaesthetic data are registered. A neurological examination and Montreal Cognitive Assessment (MoCA) are performed pre-operatively and a subset of patients fill in questionnaires on somatic and mental health (depression, anxiety and stress). RESULTS: Four-hundred-fifty patients (58% male; median age: 56 years) have been enrolled in the ABC. The planned spinal anaesthetic procedure was not attempted for various reasons in eleven patients, in fourteen patients the spinal puncture failed and in twelve patients CSF aspiration was unsuccessful. A mean of 9.3 mL CSF was obtained in the remaining 413 of patients. Most patients had a minor medical history and 60% scored in the normal range on the MoCA (median score: 26). CONCLUSIONS: The ABC is an ongoing biobanking project that can contribute to CSF-based biomarker research. The large sample size with constant sampling methods and extensive patient phenotyping provide excellent conditions for future neuroscientific research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,366
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,228
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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