Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., a new member of the family Peptostreptococcaceae, isolated from human clinical samples
Notice bibliographique
Résumé
A rod-shaped, motile anaerobic bacterium, designated CCRI-22567 T , was isolated from a vaginal sample of a woman diagnosed with bacterial vaginosis and subjected to a polyphasic taxonomic study. The novel strain was capable of growth at 30–42 °C (optimum, 42 °C), at pH 5.5–8.5 (optimum, pH 7.0–7.5) and in the presence of 0–1.5 % (w/v) NaCl (optimally at 0.5 % NaCl). The phylogenetic trees based on 16S rRNA gene sequences showed that strain CCRI-22567 T forms a distinct evolutionary lineage independent of other taxa in the family Peptostreptococcaceae . Strain CCRI-22567 T exhibited 90.1 % 16S rRNA gene sequence similarity to Peptoanaerobacter stomatis ACC19a T and 89.7 % to Eubacterium yurii subsp. schtitka ATCC 43716. The three closest organisms with an available whole genome were compared to strain CCRI-22567 T for genomic relatedness assessment. The genomic average nucleotide identities (OrthoANIu) obtained with Peptoanaerobacter stomatis ACC19a T , Eubacterium yurii subsp. margaretiae ATCC 43715 and Filifactor alocis ATCC 35896 T were 71.8, 70.3 and 69.6 %, respectively. Strain CCRI-22567 T contained C 18 : 1 ω9 c and C 18 : 1 ω9 c DMA as the major fatty acids. The DNA G+C content of strain CCRI-22567 T based on its genome sequence was 33.8 mol%. On the basis of the phylogenetic, chemotaxonomic and other phenotypic properties, strain CCRI-22567 T is considered to represent a new genus and species within the family Peptostreptococcaceae , for which the name Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., is proposed. The type strain of Criibacterium bergeronii is CCRI-22567 T (=LMG 31278 T =DSM 107614 T =CCUG 72594 T ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».