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Enregistrement W3133386458 · doi:10.21203/rs.3.rs-155292/v1

Mutation and Microsatellite Burden Predict Response to PD-1 Inhibition in Children with Germline DNA Replication Repair Deficiency

2021· preprint· en· W3133386458 sur OpenAlexafffund
Uri Tabori, Daniel A. Morgenstern, Sumedha Sudhaman, Anirban Das, Ailish Coblentz, Jiil Chung, Simone C. Stone, Noor Alsafwani, Vanja Cabric, Liana Nobre, Vanessa Bianchi, Melissa Edwards, Lauren Sambira, Shlomi Constantini, Rina Dvir, Michal Yalon, Gadi Abebe‐Campino, Shani Caspi, Valérie Larouche, Alyssa Reddy, Michael Osborn, Gary Mason, Scott Lindhorst, Annika Bronsema, Vanan Magimairajan, Enrico Opocher, Rebecca De Mola, Magnus Sabel, Charlotta A. Frojd, David Sumerauer, David Samuel, Kristina A. Cole, Stefano Chiaravalli, Maura Massimino, Patrick Tomboc, David S. Ziegler, Ben George, An Van Damme, Nobuko Hijaya, David Gass, Rose B. McGee, Oz Mordechai, Daniel C. Bowers, Ted Laetsch, Alexander Lossos, Deborah T. Blumenthal, Tomasz Sarosiek, Jeffrey Knipstein, Anne Bendel, Lindsey M. Hoffman, Sandra Luna‐Fineman, Stefanie Zimmermann, Isabelle Scheers, Kim E. Nichols, Michal Zápotocký, Jordan R. Hansford, John M. Maris, Peter B. Dirks, Michael H. Taylor, Abhaya V. Kulkarni, Manohar Shroff, Derek S. Tsang, David Malkin, Anita Villani, Melyssa Aronson, Carol Durno, Adam Shlien, Gad Getz, Yosef E. Maruvka, Pamela S. Ohashi, Cynthia Hawkins, Trevor J. Pugh, Éric Bouffet

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchResearch Institute in Oncology and HematologyPrincess Margaret Cancer CentreMount Sinai HospitalUniversity Health NetworkCancerCare ManitobaUniversité LavalUniversity of TorontoSickKids FoundationUniversity of ManitobaCentre hospitalier universitaire de QuébecHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesStand Up To CancerCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésGermlineReplication (statistics)MicrosatelliteGeneticsGermline mutationBiologyMutationGeneVirologyAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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