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Enregistrement W3133524707 · doi:10.1093/jcag/gwab002.003

A4 THE CIRCADIAN TIMING OF INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

2021· article· en· W3133524707 sur OpenAlexaffabout
Z Taleb, Kyle Stokes, H Wang, Stephen M. Collins, Waliul I. Khan, Phillip Karpowicz

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCircadian rhythmInflammatory bowel diseaseCircadian clockColitisCLOCKBiologyInflammationPathogenesisInternal medicineImmunologyEndocrinologyMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The circadian clock is a highly conserved molecular pacemaker found in nearly every cell of the body. It consists of the genes BMAL1 and CLOCK that positively regulate CRY and PER, their negative regulators, resulting in a transcription/translation feedback loop that has a 24 hour cycle. This core clock mechanism drives the rhythmic expression of over 40% of the genome in a tissue-specific manner and therefore imposes 24 hour rhythms on many physiological processes. Shift work, which causes disruptions to the natural 24 hour physiological rhythms, has been shown to lead to an increased incidence of inflammatory bowel disease (IBD). Aims This study aims to characterize daily rhythms in inflammation and regeneration of the colon upon induction of acute colitis. We also aim to investigate the intestinal epithelial-specific effects of circadian clock disruption on overall disease progression. We hypothesize that the absence of a functional circadian clock eliminates proliferation rhythms of intestinal epithelial cells and disrupts the rhythms of inflammatory cytokines, thereby increasing the pathogenesis of IBD. Methods We tested the role of the clock in IBD using BMAL1+/+ (wild type) and BMAL1-/- (null mutant) mice. We also investigated the effects of the circadian clock specific to intestinal epithelial tissue using Vil+/+;BMAL1flox/flox (control) and VilCre/+;BMAL1flox/flox (conditional intestinal epithelial mutant) mice. Dextran Sulfate Sodium (DSS) was applied to induce acute colitis. Results We observed significantly decreased survival of BMAL1 circadian clock mutant mice when given colitis. A histology analysis indicates increased lesioning and overall inflammation in BMAL1-/- colon tissue. Disease activity and cytokine analyses reveal time-dependent severity in inflammatory response that is worse in BMAL1-/- mice. To test the circadian rhythms in intestinal regeneration of mice with IBD, we performed a 24 hour analysis comparing epithelial cell proliferation and cell death in colon tissue. We observed rhythmic expression of phosphor-histone H3 (a mitosis marker) in wild type mice which is eliminated in the BMAL1-/- lacking a circadian clock. Cell death which was measured by caspase 3 did not exhibit any differences between genotypes. Based on these results, we conclude that the loss of clock function leads to impaired regeneration during IBD, in part due to decreased and arrhythmic cell proliferation. Preliminary results in our VilCre/+;BMAL1flox/flox conditional intestinal epithelial mutant mice indicate that some of these effects may be epithelial-specific. Conclusions Our results support a critical role of the circadian clock in inflammatory bowel disease development. These data highlight that the circadian clock affects the regenerative abilities of intestinal epithelial cells. Funding Agencies CIHRChron’s and Colitis Canada, Ontario, University of Windsor

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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