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Enregistrement W3133728581 · doi:10.1016/j.mce.2021.111220

AKR1C2 and AKR1C3 expression in adipose tissue: Association with body fat distribution and regulatory variants

2021· article· en· W3133728581 sur OpenAlexafffund
Giada Ostinelli, Jinchu Vijay, Marie‐Claude Vohl, Elin Grundberg, André Tchernof

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Endocrinology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAldose Reductase and Taurine
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesCommon FundFP7 HealthCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchWellcome Trust
Mots-clésAdipose tissueBiologyAdipogenesisAdipocyteTranscription factorCell biologyEndocrinologyInternal medicineGeneticsGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Changes in androgen dynamics within adipose tissue have been proposed as modulators of body fat accumulation. In this context, AKR1C2 likely plays a significant role by inactivating 5α-dihydrotestosterone. AIM: To characterize AKR1C2 expression patterns across adipose depots and cell populations and to provide insight into the link with body fat distribution and genetic regulation. METHODS: We used RNA sequencing data from severely obese patients to assess patterns of AKR1C2 and AKR1C3 expression in abdominal adipose tissue depots and cell fractions. We additionally used data from 856 women to assess AKR1C2 heritability and to link its expression in adipose tissue with body fat distribution. Further, we used public resources to study AKR1C2 genetic regulation as well as reference epigenome data for regulatory element profiling and functional interpretation of genetic data. RESULTS: We found that mature adipocytes and adipocyte-committed adipocyte progenitor cells (APCs) had enriched expression of AKR1C2. We found adipose tissue AKR1C2 and AKR1C3 expression to be significantly and positively associated with percentage trunk fat mass in women. We identified strong genetic regulation of AKR1C2 by rs28571848 and rs34477787 located on the binding sites of two nuclear transcription factors, namely retinoid acid-related orphan receptor alpha and the glucocorticoid receptor. CONCLUSION: We confirm the link between AKR1C2, adipogenic differentiation and adipose tissue distribution. We provide insight into genetic regulation of AKR1C2 by identifying regulatory variants mapping to binding sites for the glucocorticoid receptor and retinoid acid-related orphan receptor alpha which may in part mediate the effect of AKR1C2 expression on body fat distribution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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