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Enregistrement W3133758547 · doi:10.1101/2021.02.27.432868

Bioptim, a Python framework for Musculoskeletal Optimal Control in Biomechanics

2021· preprint· en· W3133758547 sur OpenAlexaff
Benjamin Michaud, François Bailly, Eve Charbonneau, Amedeo Ceglia, Léa Sanchez, Mickaël Begon

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueProsthetics and Rehabilitation Robotics
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPython (programming language)Computer scienceTorqueMotion captureOptimal controlBiomechanicsSimulationModel predictive controlNonlinear systemSoftwareControl theory (sociology)Control engineeringArtificial intelligenceMotion (physics)MathematicsEngineeringMathematical optimizationControl (management)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Musculoskeletal simulations are useful in biomechanics to investigate the causes of movement disorder, to estimate non-measurable physiological quantities or to study the optimality of human movement. We introduce Bioptim , an easy-to-use Python framework for biomechanical optimal control, handling musculoskeletal models. Relying on algorithmic differentiation and the multiple shooting formulation, Bioptim interfaces nonlinear solvers to quickly provide dynamically consistent optimal solutions. The software is both computationally efficient (C++ core) and easily customizable, thanks to its Python interface. It allows to quickly define a variety of biomechanical problems such as motion tracking/prediction, muscle-driven simulations, parameters optimization, multiphase problems, etc. It is also intended for real-time applications such as moving horizon estimation and model predictive control. Six contrasting examples are presented, comprising various models, dynamics, objective functions and constraints. They include data-driven simulations (i.e., a multiphase muscle driven gait cycle and an upper-limb real-time moving horizon estimation of muscle forces) and predictive simulations (i.e., a muscle-driven pointing task, a twisting somersault with a quaternion-based model, a position controller using external forces, and a multiphase torque-driven maximum-height jump motion).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,421
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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